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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.9404Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 159 / 3259021 5 / 403641 1235 / 25718729 17 / 491920 159 / 3259021 5 / 403641 1235 / 25718729 17 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 9 / 261599   166 / 7554651 -- 9 / 261599 0 / 2128 166 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 7 / 233710   2 / 56549 -- 7 / 233710 0 / 43127
cerebrum 5 / 228104 -- -- -- 5 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 5 / 39315 -- -- -- 5 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 41 / 718928   209 / 2760977 -- 41 / 718928 0 / 9837 209 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 8 / 211918 -- -- -- 8 / 211918 --
eye 7 / 94929 -- 4 / 138066 -- 7 / 94929 -- 4 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 25 / 548222 -- 0 / 34979 -- 25 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 55 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 55 / 1231698 --
kidney 1 / 121184   53 / 1415985 -- 1 / 121184 0 / 2215 53 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 43 / 595880 -- 1 / 16187 -- 43 / 595880 --
liver     8 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 8 / 527425 --
lung 4 / 26861 4 / 72516 99 / 943009 -- 4 / 26861 4 / 72516 99 / 943009 --
lymph node   -- 11 / 344354 -- 0 / 14648 -- 11 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 1 / 216846 68 / 960632 5 / 178606 4 / 85464 1 / 216846 68 / 960632 5 / 178606
muscle   -- 15 / 137075 -- 0 / 24130 -- 15 / 137075 --
nervous 8 / 35780 -- -- -- 8 / 35780 -- -- --
ovary   -- 36 / 354066 -- 0 / 43149 -- 36 / 354066 --
pancreas 6 / 75220   76 / 1338446 -- 6 / 75220 0 / 34 76 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 2 / 3907 -- -- -- 2 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 11 / 145854 -- 0 / 17986 -- 11 / 145854 --
placenta 13 / 37653 -- 25 / 292212 -- 13 / 37653 -- 25 / 292212 --
pooled tissue 9 / 99675 -- -- -- 9 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   40 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 40 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 14 / 636203 -- 4 / 82470 -- 14 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     40 / 615945 5 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 40 / 615945 5 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     26 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 26 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach   -- 17 / 218318 -- 0 / 21241 -- 17 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 5 / 116987   44 / 736319 -- 5 / 116987 0 / 2634 44 / 736319 --
thymus 3 / 100203   10 / 346181 -- 3 / 100203 0 / 20273 10 / 346181 --
thyroid 3 / 8821 -- -- -- 3 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 18 / 262740     -- 18 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 33 / 206823 -- 1 / 6854 -- 33 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 71 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 71 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 18 / 531904 7 / 212613 -- -- 18 / 531904 7 / 212613