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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.927Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 347 / 3259021 63 / 403641 2262 / 25718729 13 / 491920 347 / 3259021 63 / 403641 2262 / 25718729 13 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 -- 3 / 64924 -- 3 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow 11 / 100926 -- 8 / 103390 -- 11 / 100926 -- 8 / 103390 --
brain 15 / 261599   976 / 7554651 -- 15 / 261599 0 / 2128 976 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 8 / 233710   1 / 56549 -- 8 / 233710 0 / 43127
cerebrum 28 / 228104 -- -- -- 28 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 7 / 39315 -- -- -- 7 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 129 / 718928 2 / 9837 298 / 2760977 -- 129 / 718928 2 / 9837 298 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 26 / 211918 -- -- -- 26 / 211918 --
eye 8 / 94929 -- 5 / 138066 -- 8 / 94929 -- 5 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 -- 37 / 548222 -- 2 / 34979 -- 37 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 119 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 119 / 1231698 --
kidney 12 / 121184   76 / 1415985 -- 12 / 121184 0 / 2215 76 / 1415985 --
limb   -- 52 / 595880 -- 0 / 16187 -- 52 / 595880 --
liver 4 / 104633   42 / 527425 -- 4 / 104633 0 / 6685 42 / 527425 --
lung   10 / 72516 80 / 943009 -- 0 / 26861 10 / 72516 80 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 14 / 344354 -- 2 / 14648 -- 14 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 8 / 85464 31 / 216846 21 / 960632 4 / 178606 8 / 85464 31 / 216846 21 / 960632 4 / 178606
muscle 3 / 24130 -- 4 / 137075 -- 3 / 24130 -- 4 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 5 / 43149 -- 23 / 354066 -- 5 / 43149 -- 23 / 354066 --
pancreas 8 / 75220   121 / 1338446 -- 8 / 75220 0 / 34 121 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 5 / 145854 -- 0 / 17986 -- 5 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 9 / 292212 -- 2 / 37653 -- 9 / 292212 --
pooled tissue 11 / 99675 -- -- -- 11 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   9 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 9 / 386047 --
retina 15 / 82470 -- 18 / 636203 -- 15 / 82470 -- 18 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 15 / 85891 11 / 31511 13 / 615945   15 / 85891 11 / 31511 13 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492 2 / 17831 11 / 386635 -- 4 / 73492 2 / 17831 11 / 386635 --
stem cell -- -- 39 / 234473 -- -- -- 39 / 234473 --
stomach   -- 23 / 218318 -- 0 / 21241 -- 23 / 218318 --
synovium 4 / 16875 -- -- -- 4 / 16875 -- -- --
testis 7 / 116987   17 / 736319 -- 7 / 116987 0 / 2634 17 / 736319 --
thymus 14 / 100203 4 / 20273 23 / 346181 -- 14 / 100203 4 / 20273 23 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 21 / 262740 2 / 14058 4 / 25954 -- 21 / 262740 2 / 14058 4 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 4 / 206823 -- 1 / 6854 -- 4 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 91 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 91 / 1092595 --
white blood cells -- -- 12 / 398838 -- -- -- 12 / 398838 --
whole body -- -- 71 / 531904 9 / 212613 -- -- 71 / 531904 9 / 212613