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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.89888Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 244 / 3259021 26 / 403641 111 / 25718729 1 / 491920 244 / 3259021 26 / 403641 111 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 --   -- 1 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 7 / 100926 --   -- 7 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 9 / 261599 1 / 2128 27 / 7554651 -- 9 / 261599 1 / 2128 27 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 --     4 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 5 / 228104 -- -- -- 5 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804   -- -- 4 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 54 / 718928   10 / 2760977 -- 54 / 718928 0 / 9837 10 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 7 / 94929 --   -- 7 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 4 / 34979 --   -- 4 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 3 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 3 / 1231698 --
kidney 28 / 121184   32 / 1415985 -- 28 / 121184 0 / 2215 32 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver 14 / 104633 2 / 6685 2 / 527425 -- 14 / 104633 2 / 6685 2 / 527425 --
lung 3 / 26861 8 / 72516 15 / 943009 -- 3 / 26861 8 / 72516 15 / 943009 --
lymph node 3 / 14648 --   -- 3 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 13 / 85464 14 / 216846 3 / 960632 1 / 178606 13 / 85464 14 / 216846 3 / 960632 1 / 178606
muscle 3 / 24130 --   -- 3 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary 4 / 43149 --   -- 4 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   1 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 1 / 1338446 --
pancreatic islet 12 / 30771 -- -- -- 12 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 --   -- 2 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 9 / 99675 -- -- -- 9 / 99675 -- -- --
prostate 4 / 23701     -- 4 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 6 / 82470 --   -- 6 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891 1 / 31511 1 / 615945   3 / 85891 1 / 31511 1 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 7 / 73492   2 / 386635 -- 7 / 73492 0 / 17831 2 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach 1 / 21241 --   -- 1 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 2 / 116987   5 / 736319 -- 2 / 116987 0 / 2634 5 / 736319 --
thymus 7 / 100203   4 / 346181 -- 7 / 100203 0 / 20273 4 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 15 / 262740     -- 15 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 2 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 2 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904   -- -- 2 / 531904 0 / 212613