Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.88796Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 67 / 3259021   150 / 25718729 1 / 491920 67 / 3259021 0 / 403641 150 / 25718729 1 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 --   -- 1 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain     73 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 73 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 2 / 233710   0 / 56549 -- 2 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 40 / 718928   11 / 2760977 -- 40 / 718928 0 / 9837 11 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   -- 5 / 138066 -- 0 / 94929 -- 5 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 3 / 548222 -- 0 / 34979 -- 3 / 548222 --
heart   -- 4 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 4 / 1231698 --
kidney     3 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver 1 / 104633   2 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 2 / 527425 --
lung     5 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 5 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     1 / 960632   0 / 85464 0 / 216846 1 / 960632 0 / 178606
muscle 1 / 24130 --   -- 1 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 7 / 43149 --   -- 7 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas     8 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 8 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 14 / 37653 -- 5 / 292212 -- 14 / 37653 -- 5 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina   -- 5 / 636203 -- 0 / 82470 -- 5 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     4 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 4 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492   1 / 386635 -- 1 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     4 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 4 / 736319 --
thymus     1 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 1 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 2 / 262740     -- 2 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 7 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 7 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- --   1 / 212613 -- -- 0 / 531904 1 / 212613