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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.85544Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 41 / 3259021 19 / 403641 89 / 25718729 4 / 491920 41 / 3259021 19 / 403641 89 / 25718729 4 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 1 / 261599   20 / 7554651 -- 1 / 261599 0 / 2128 20 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 3 / 233710 2 / 43127 1 / 56549 -- 3 / 233710 2 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 15 / 718928   17 / 2760977 -- 15 / 718928 0 / 9837 17 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 5 / 94929 --   -- 5 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   --   -- 0 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart   --   -- 0 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney     2 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 2 / 1415985 --
limb   -- 2 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver       -- 0 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung   4 / 72516   -- 0 / 26861 4 / 72516 0 / 943009 --
lymph node   -- 1 / 344354 -- 0 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 2 / 85464 15 / 216846 9 / 960632 1 / 178606 2 / 85464 15 / 216846 9 / 960632 1 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas     1 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 1 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 4 / 37653 -- 1 / 292212 -- 4 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate     2 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 2 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 4 / 636203 -- 4 / 82470 -- 4 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891   14 / 615945   3 / 85891 0 / 31511 14 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     1 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     6 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 6 / 736319 --
thymus     1 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 1 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue       -- 0 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 1 / 206823 -- 1 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   --   -- 0 / 12366 -- 0 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 3 / 531904 1 / 212613 -- -- 3 / 531904 1 / 212613