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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.8552Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 213 / 3259021 51 / 403641 1606 / 25718729 54 / 491920 213 / 3259021 51 / 403641 1606 / 25718729 54 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 14 / 64924 -- 2 / 38915 -- 14 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 -- 15 / 103390 -- 1 / 100926 -- 15 / 103390 --
brain 2 / 261599   267 / 7554651 -- 2 / 261599 0 / 2128 267 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 9 / 56549 -- 42 / 233710   9 / 56549 -- 42 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804   -- -- 4 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 101 / 718928 6 / 9837 211 / 2760977 -- 101 / 718928 6 / 9837 211 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 4 / 211918 -- -- -- 4 / 211918 --
eye 4 / 94929 -- 8 / 138066 -- 4 / 94929 -- 8 / 138066 --
gastrointestinal tract 5 / 34979 -- 34 / 548222 -- 5 / 34979 -- 34 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 144 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 144 / 1231698 --
kidney 5 / 121184   55 / 1415985 -- 5 / 121184 0 / 2215 55 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 69 / 595880 -- 1 / 16187 -- 69 / 595880 --
liver 3 / 104633   52 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 52 / 527425 --
lung   3 / 72516 72 / 943009 -- 0 / 26861 3 / 72516 72 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 4 / 344354 -- 1 / 14648 -- 4 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 22 / 216846 17 / 960632 17 / 178606 1 / 85464 22 / 216846 17 / 960632 17 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 1 / 137075 -- 2 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 6 / 43149 -- 18 / 354066 -- 6 / 43149 -- 18 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   88 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 88 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 1 / 145854 -- 1 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   -- 31 / 292212 -- 0 / 37653 -- 31 / 292212 --
pooled tissue 4 / 99675 -- -- -- 4 / 99675 -- -- --
prostate     17 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 17 / 386047 --
retina 6 / 82470 -- 113 / 636203 -- 6 / 82470 -- 113 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     27 / 615945 13 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 27 / 615945 13 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen   18 / 17831 56 / 386635 -- 0 / 73492 18 / 17831 56 / 386635 --
stem cell -- -- 26 / 234473 -- -- -- 26 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 20 / 218318 -- 2 / 21241 -- 20 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 6 / 116987   37 / 736319 -- 6 / 116987 0 / 2634 37 / 736319 --
thymus 16 / 100203   67 / 346181 -- 16 / 100203 0 / 20273 67 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 21 / 262740 2 / 14058 5 / 25954 -- 21 / 262740 2 / 14058 5 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 6 / 206823 -- 1 / 6854 -- 6 / 206823 --
vascular   -- 5 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 5 / 1092595 --
white blood cells -- -- 23 / 398838 -- -- -- 23 / 398838 --
whole body -- -- 57 / 531904 24 / 212613 -- -- 57 / 531904 24 / 212613