Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.85410Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 428 / 3259021 70 / 403641 402 / 25718729 13 / 491920 428 / 3259021 70 / 403641 402 / 25718729 13 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 --   -- 3 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 5 / 100926 -- 3 / 103390 -- 5 / 100926 -- 3 / 103390 --
brain 48 / 261599   61 / 7554651 -- 48 / 261599 0 / 2128 61 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 -- 3 / 233710   5 / 56549 -- 3 / 233710 0 / 43127
cerebrum 11 / 228104 -- -- -- 11 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 5 / 39315 -- -- -- 5 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 155 / 718928 2 / 9837 95 / 2760977 -- 155 / 718928 2 / 9837 95 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 55 / 94929 -- 7 / 138066 -- 55 / 94929 -- 7 / 138066 --
gastrointestinal tract 4 / 34979 -- 18 / 548222 -- 4 / 34979 -- 18 / 548222 --
heart 6 / 49793 -- 30 / 1231698 -- 6 / 49793 -- 30 / 1231698 --
kidney 6 / 121184 1 / 2215 27 / 1415985 -- 6 / 121184 1 / 2215 27 / 1415985 --
limb 2 / 16187 -- 42 / 595880 -- 2 / 16187 -- 42 / 595880 --
liver 1 / 104633   7 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 7 / 527425 --
lung 1 / 26861 15 / 72516 13 / 943009 -- 1 / 26861 15 / 72516 13 / 943009 --
lymph node 3 / 14648 -- 5 / 344354 -- 3 / 14648 -- 5 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 2 / 85464 41 / 216846 13 / 960632   2 / 85464 41 / 216846 13 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary 5 / 43149 -- 1 / 354066 -- 5 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas 9 / 75220   14 / 1338446 -- 9 / 75220 0 / 34 14 / 1338446 --
pancreatic islet 5 / 30771 -- -- -- 5 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 --   -- 1 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 10 / 99675 -- -- -- 10 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   5 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 5 / 386047 --
retina 11 / 82470 -- 3 / 636203 -- 11 / 82470 -- 3 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 4 / 85891 6 / 31511 5 / 615945 2 / 57574 4 / 85891 6 / 31511 5 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 6 / 73492 1 / 17831 8 / 386635 -- 6 / 73492 1 / 17831 8 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach 4 / 21241 -- 7 / 218318 -- 4 / 21241 -- 7 / 218318 --
synovium 3 / 16875 -- -- -- 3 / 16875 -- -- --
testis 12 / 116987 1 / 2634 7 / 736319 -- 12 / 116987 1 / 2634 7 / 736319 --
thymus 15 / 100203 1 / 20273 8 / 346181 -- 15 / 100203 1 / 20273 8 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 27 / 262740 2 / 14058   -- 27 / 262740 2 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 2 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 2 / 1092595 --
white blood cells -- -- 8 / 398838 -- -- -- 8 / 398838 --
whole body -- -- 7 / 531904 11 / 212613 -- -- 7 / 531904 11 / 212613