Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.85162Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 114 / 3259021 26 / 403641 69 / 25718729 2 / 491920 114 / 3259021 26 / 403641 69 / 25718729 2 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 2 / 100926 --   -- 2 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 6 / 261599   19 / 7554651 -- 6 / 261599 0 / 2128 19 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 --     5 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 4 / 228104 -- -- -- 4 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 4 / 51804   -- -- 4 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 21 / 718928   8 / 2760977 -- 21 / 718928 0 / 9837 8 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 2 / 94929 -- 1 / 138066 -- 2 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 4 / 548222 -- 1 / 34979 -- 4 / 548222 --
heart 4 / 49793 -- 7 / 1231698 -- 4 / 49793 -- 7 / 1231698 --
kidney     3 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb 2 / 16187 -- 2 / 595880 -- 2 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver 2 / 104633     -- 2 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung 4 / 26861 3 / 72516 1 / 943009 -- 4 / 26861 3 / 72516 1 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 1 / 344354 -- 1 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   20 / 216846 1 / 960632   0 / 85464 20 / 216846 1 / 960632 0 / 178606
muscle 1 / 24130 --   -- 1 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 3 / 354066 -- 1 / 43149 -- 3 / 354066 --
pancreas 2 / 75220   1 / 1338446 -- 2 / 75220 0 / 34 1 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 1 / 82470 --   -- 1 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891 1 / 31511 5 / 615945   2 / 85891 1 / 31511 5 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 11 / 73492   2 / 386635 -- 11 / 73492 0 / 17831 2 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 4 / 116987   1 / 736319 -- 4 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus 12 / 100203 2 / 20273   -- 12 / 100203 2 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 13 / 262740     -- 13 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 3 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 3 / 1092595 --
white blood cells -- -- 3 / 398838 -- -- -- 3 / 398838 --
whole body -- -- 1 / 531904 2 / 212613 -- -- 1 / 531904 2 / 212613