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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.8042Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 28 / 3259021 4 / 403641 171 / 25718729 2 / 491920 28 / 3259021 4 / 403641 171 / 25718729 2 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow   -- 23 / 103390 -- 0 / 100926 -- 23 / 103390 --
brain 2 / 261599   67 / 7554651 -- 2 / 261599 0 / 2128 67 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 4 / 228104 -- -- -- 4 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 5 / 718928   7 / 2760977 -- 5 / 718928 0 / 9837 7 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   -- 1 / 138066 -- 0 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   --   -- 0 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart   --   -- 0 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney       -- 0 / 121184 0 / 2215 0 / 1415985 --
limb 1 / 16187 --   -- 1 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver     1 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung   2 / 72516 1 / 943009 -- 0 / 26861 2 / 72516 1 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   2 / 216846 1 / 960632 1 / 178606 0 / 85464 2 / 216846 1 / 960632 1 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   -- 4 / 354066 -- 0 / 43149 -- 4 / 354066 --
pancreas     1 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 1 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 5 / 292212 -- 1 / 37653 -- 5 / 292212 --
pooled tissue 1 / 99675 -- -- -- 1 / 99675 -- -- --
prostate     1 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin       1 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- -- 17 / 234473 -- -- -- 17 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium 10 / 16875 -- -- -- 10 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   6 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 6 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 2 / 262740   1 / 25954 -- 2 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 28 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 28 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 6 / 531904   -- -- 6 / 531904 0 / 212613