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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.7800Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 107 / 3259021 12 / 403641 366 / 25718729 3 / 491920 107 / 3259021 12 / 403641 366 / 25718729 3 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 3 / 100926 -- 2 / 103390 -- 3 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 5 / 261599   43 / 7554651 -- 5 / 261599 0 / 2128 43 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 3 / 228104 -- -- -- 3 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 9 / 39315 -- -- -- 9 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 7 / 718928   6 / 2760977 -- 7 / 718928 0 / 9837 6 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 4 / 94929 --   -- 4 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 2 / 548222 -- 0 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart   -- 5 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 5 / 1231698 --
kidney 13 / 121184   21 / 1415985 -- 13 / 121184 0 / 2215 21 / 1415985 --
limb   -- 1 / 595880 -- 0 / 16187 -- 1 / 595880 --
liver 1 / 104633   5 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 5 / 527425 --
lung   2 / 72516 6 / 943009 -- 0 / 26861 2 / 72516 6 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 7 / 344354 -- 2 / 14648 -- 7 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 6 / 85464 10 / 216846 8 / 960632   6 / 85464 10 / 216846 8 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 8 / 43149 -- 3 / 354066 -- 8 / 43149 -- 3 / 354066 --
pancreas     12 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 12 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 3 / 292212 -- 1 / 37653 -- 3 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     4 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 4 / 386047 --
retina 3 / 82470 --   -- 3 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891   5 / 615945 2 / 57574 2 / 85891 0 / 31511 5 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492   1 / 386635 -- 3 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   1 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus 8 / 100203   9 / 346181 -- 8 / 100203 0 / 20273 9 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 20 / 262740   1 / 25954 -- 20 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 4 / 206823 -- 0 / 6854 -- 4 / 206823 --
vascular 6 / 12366 -- 99 / 1092595 -- 6 / 12366 -- 99 / 1092595 --
white blood cells -- -- 15 / 398838 -- -- -- 15 / 398838 --
whole body -- -- 98 / 531904 1 / 212613 -- -- 98 / 531904 1 / 212613