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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.757Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 632 / 3259021 136 / 403641 3040 / 25718729 50 / 491920 632 / 3259021 136 / 403641 3040 / 25718729 50 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 8 / 38915 -- 4 / 64924 -- 8 / 38915 -- 4 / 64924 --
bone marrow 57 / 100926 -- 9 / 103390 -- 57 / 100926 -- 9 / 103390 --
brain 18 / 261599   583 / 7554651 -- 18 / 261599 0 / 2128 583 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 7 / 56549 -- 55 / 233710 1 / 43127 7 / 56549 -- 55 / 233710 1 / 43127
cerebrum 51 / 228104 -- -- -- 51 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 22 / 51804   -- -- 22 / 51804 0 / 689 -- --
ear 5 / 39315 -- -- -- 5 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 144 / 718928 7 / 9837 353 / 2760977 -- 144 / 718928 7 / 9837 353 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 7 / 211918 -- -- -- 7 / 211918 --
eye 14 / 94929 -- 8 / 138066 -- 14 / 94929 -- 8 / 138066 --
gastrointestinal tract 25 / 34979 -- 69 / 548222 -- 25 / 34979 -- 69 / 548222 --
heart 10 / 49793 -- 175 / 1231698 -- 10 / 49793 -- 175 / 1231698 --
kidney 24 / 121184 1 / 2215 176 / 1415985 -- 24 / 121184 1 / 2215 176 / 1415985 --
limb 8 / 16187 -- 77 / 595880 -- 8 / 16187 -- 77 / 595880 --
liver 11 / 104633 1 / 6685 41 / 527425 -- 11 / 104633 1 / 6685 41 / 527425 --
lung 2 / 26861 38 / 72516 182 / 943009 -- 2 / 26861 38 / 72516 182 / 943009 --
lymph node   -- 61 / 344354 -- 0 / 14648 -- 61 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 10 / 85464 52 / 216846 146 / 960632 19 / 178606 10 / 85464 52 / 216846 146 / 960632 19 / 178606
muscle 13 / 24130 -- 16 / 137075 -- 13 / 24130 -- 16 / 137075 --
nervous 5 / 35780 -- -- -- 5 / 35780 -- -- --
ovary 8 / 43149 -- 42 / 354066 -- 8 / 43149 -- 42 / 354066 --
pancreas 12 / 75220   154 / 1338446 -- 12 / 75220 0 / 34 154 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 4 / 17986 -- 11 / 145854 -- 4 / 17986 -- 11 / 145854 --
placenta 7 / 37653 -- 39 / 292212 -- 7 / 37653 -- 39 / 292212 --
pooled tissue 14 / 99675 -- -- -- 14 / 99675 -- -- --
prostate 3 / 23701   58 / 386047 -- 3 / 23701 0 / 5 58 / 386047 --
retina 9 / 82470 -- 58 / 636203 -- 9 / 82470 -- 58 / 636203 --
salivary gland 5 / 18434   -- -- 5 / 18434 0 / 958 -- --
skin 12 / 85891 2 / 31511 74 / 615945 7 / 57574 12 / 85891 2 / 31511 74 / 615945 7 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 34 / 73492 19 / 17831 62 / 386635 -- 34 / 73492 19 / 17831 62 / 386635 --
stem cell -- -- 31 / 234473 -- -- -- 31 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 58 / 218318 -- 2 / 21241 -- 58 / 218318 --
synovium 8 / 16875 -- -- -- 8 / 16875 -- -- --
testis 13 / 116987   63 / 736319 -- 13 / 116987 0 / 2634 63 / 736319 --
thymus 13 / 100203 8 / 20273 75 / 346181 -- 13 / 100203 8 / 20273 75 / 346181 --
thyroid 2 / 8821 -- -- -- 2 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 46 / 262740 7 / 14058 2 / 25954 -- 46 / 262740 7 / 14058 2 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 18 / 206823 -- 2 / 6854 -- 18 / 206823 --
vascular   -- 211 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 211 / 1092595 --
white blood cells -- -- 58 / 398838 -- -- -- 58 / 398838 --
whole body -- -- 64 / 531904 23 / 212613 -- -- 64 / 531904 23 / 212613