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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.68170Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 40 / 3259021   51 / 25718729   40 / 3259021 0 / 403641 51 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 5 / 100926 --   -- 5 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 3 / 261599   9 / 7554651 -- 3 / 261599 0 / 2128 9 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 1 / 228104 -- -- -- 1 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 2 / 718928     -- 2 / 718928 0 / 9837 0 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 3 / 94929 --   -- 3 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 1 / 548222 -- 0 / 34979 -- 1 / 548222 --
heart   -- 1 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 1 / 1231698 --
kidney     3 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb   -- 1 / 595880 -- 0 / 16187 -- 1 / 595880 --
liver       -- 0 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung       -- 0 / 26861 0 / 72516 0 / 943009 --
lymph node   -- 2 / 344354 -- 0 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland         0 / 85464 0 / 216846 0 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas     2 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 2 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 1 / 99675 -- -- -- 1 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 25 / 82470 -- 27 / 636203 -- 25 / 82470 -- 27 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     1 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 1 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis       -- 0 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue       -- 0 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 1 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 1 / 1092595 --
white blood cells -- -- 2 / 398838 -- -- -- 2 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613