Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.676Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 105 / 3259021 20 / 403641 401 / 25718729 8 / 491920 105 / 3259021 20 / 403641 401 / 25718729 8 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 1 / 64924 -- 2 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 8 / 100926 -- 4 / 103390 -- 8 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain     44 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 44 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 4 / 233710   0 / 56549 -- 4 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 48 / 718928   96 / 2760977 -- 48 / 718928 0 / 9837 96 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 2 / 138066 -- 3 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 11 / 548222 -- 0 / 34979 -- 11 / 548222 --
heart   -- 10 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 10 / 1231698 --
kidney   1 / 2215 25 / 1415985 -- 0 / 121184 1 / 2215 25 / 1415985 --
limb   -- 13 / 595880 -- 0 / 16187 -- 13 / 595880 --
liver     9 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 9 / 527425 --
lung   9 / 72516 20 / 943009 -- 0 / 26861 9 / 72516 20 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 12 / 344354 -- 2 / 14648 -- 12 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   6 / 216846 12 / 960632 5 / 178606 0 / 85464 6 / 216846 12 / 960632 5 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 3 / 137075 -- 1 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   -- 5 / 354066 -- 0 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas 10 / 75220   15 / 1338446 -- 10 / 75220 0 / 34 15 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 3 / 145854 -- 0 / 17986 -- 3 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 4 / 292212 -- 2 / 37653 -- 4 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701   9 / 386047 -- 2 / 23701 0 / 5 9 / 386047 --
retina   -- 7 / 636203 -- 0 / 82470 -- 7 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin   1 / 31511 5 / 615945 1 / 57574 0 / 85891 1 / 31511 5 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492   9 / 386635 -- 2 / 73492 0 / 17831 9 / 386635 --
stem cell -- -- 11 / 234473 -- -- -- 11 / 234473 --
stomach   -- 6 / 218318 -- 0 / 21241 -- 6 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 9 / 116987   13 / 736319 -- 9 / 116987 0 / 2634 13 / 736319 --
thymus 3 / 100203   14 / 346181 -- 3 / 100203 0 / 20273 14 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 5 / 262740 3 / 14058   -- 5 / 262740 3 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 6 / 206823 -- 0 / 6854 -- 6 / 206823 --
vascular   -- 10 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 10 / 1092595 --
white blood cells -- -- 10 / 398838 -- -- -- 10 / 398838 --
whole body -- -- 7 / 531904 2 / 212613 -- -- 7 / 531904 2 / 212613