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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.6272Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 42 / 3259021 4 / 403641 123 / 25718729 5 / 491920 42 / 3259021 4 / 403641 123 / 25718729 5 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 10 / 64924 -- 0 / 38915 -- 10 / 64924 --
bone marrow 15 / 100926 -- 4 / 103390 -- 15 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain     12 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 12 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue     5 / 2760977 -- 0 / 718928 0 / 9837 5 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   -- 1 / 138066 -- 0 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 1 / 548222 -- 0 / 34979 -- 1 / 548222 --
heart   --   -- 0 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney     7 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 7 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver     4 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 4 / 527425 --
lung   1 / 72516 4 / 943009 -- 0 / 26861 1 / 72516 4 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 7 / 344354 -- 2 / 14648 -- 7 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 5 / 85464 3 / 216846 22 / 960632 3 / 178606 5 / 85464 3 / 216846 22 / 960632 3 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 2 / 354066 -- 1 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   3 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 3 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   -- 1 / 292212 -- 0 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   1 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891   2 / 615945 1 / 57574 1 / 85891 0 / 31511 2 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492   8 / 386635 -- 4 / 73492 0 / 17831 8 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     2 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus     4 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 4 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 6 / 262740     -- 6 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 2 / 206823 -- 1 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular   -- 10 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 10 / 1092595 --
white blood cells -- -- 8 / 398838 -- -- -- 8 / 398838 --
whole body -- --   1 / 212613 -- -- 0 / 531904 1 / 212613