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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.60590Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 451 / 3259021 42 / 403641 817 / 25718729 15 / 491920 451 / 3259021 42 / 403641 817 / 25718729 15 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 19 / 38915 -- 1 / 64924 -- 19 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 2 / 100926 --   -- 2 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 22 / 261599   128 / 7554651 -- 22 / 261599 0 / 2128 128 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 8 / 56549 -- 5 / 233710   8 / 56549 -- 5 / 233710 0 / 43127
cerebrum 6 / 228104 -- -- -- 6 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 98 / 718928 4 / 9837 103 / 2760977 -- 98 / 718928 4 / 9837 103 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 9 / 211918 -- -- -- 9 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 6 / 138066 -- 3 / 94929 -- 6 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 18 / 548222 -- 0 / 34979 -- 18 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 21 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 21 / 1231698 --
kidney 13 / 121184   48 / 1415985 -- 13 / 121184 0 / 2215 48 / 1415985 --
limb 7 / 16187 -- 19 / 595880 -- 7 / 16187 -- 19 / 595880 --
liver 2 / 104633   2 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 2 / 527425 --
lung 4 / 26861   28 / 943009 -- 4 / 26861 0 / 72516 28 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 4 / 344354 -- 1 / 14648 -- 4 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 2 / 85464 23 / 216846 22 / 960632 5 / 178606 2 / 85464 23 / 216846 22 / 960632 5 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 2 / 137075 -- 2 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 60 / 43149 -- 14 / 354066 -- 60 / 43149 -- 14 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   19 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 19 / 1338446 --
pancreatic islet 4 / 30771 -- -- -- 4 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 83 / 37653 -- 17 / 292212 -- 83 / 37653 -- 17 / 292212 --
pooled tissue 10 / 99675 -- -- -- 10 / 99675 -- -- --
prostate     11 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 11 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 3 / 636203 -- 4 / 82470 -- 3 / 636203 --
salivary gland 3 / 18434 1 / 958 -- -- 3 / 18434 1 / 958 -- --
skin 12 / 85891 4 / 31511 15 / 615945   12 / 85891 4 / 31511 15 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     13 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 13 / 386635 --
stem cell -- -- 23 / 234473 -- -- -- 23 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium 4 / 16875 -- -- -- 4 / 16875 -- -- --
testis 6 / 116987   21 / 736319 -- 6 / 116987 0 / 2634 21 / 736319 --
thymus 7 / 100203   18 / 346181 -- 7 / 100203 0 / 20273 18 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 61 / 262740 10 / 14058 3 / 25954 -- 61 / 262740 10 / 14058 3 / 25954 --
uterus   -- 2 / 206823 -- 0 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 237 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 237 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 3 / 531904 10 / 212613 -- -- 3 / 531904 10 / 212613