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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.57247Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 293 / 3259021   281 / 25718729   293 / 3259021 0 / 403641 281 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 219 / 261599   256 / 7554651 -- 219 / 261599 0 / 2128 256 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 11 / 233710   4 / 56549 -- 11 / 233710 0 / 43127
cerebrum 4 / 228104 -- -- -- 4 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 16 / 718928   2 / 2760977 -- 16 / 718928 0 / 9837 2 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 3 / 94929 --   -- 3 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 2 / 548222 -- 0 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart   --   -- 0 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney     2 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 2 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver       -- 0 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung       -- 0 / 26861 0 / 72516 0 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     1 / 960632   0 / 85464 0 / 216846 1 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas       -- 0 / 75220 0 / 34 0 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 4 / 99675 -- -- -- 4 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 12 / 82470 -- 7 / 636203 -- 12 / 82470 -- 7 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin         0 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987     -- 1 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 30 / 262740     -- 30 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   --   -- 0 / 12366 -- 0 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613