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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.56769Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 657 / 3259021 93 / 403641 3071 / 25718729 16 / 491920 657 / 3259021 93 / 403641 3071 / 25718729 16 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 -- 23 / 64924 -- 3 / 38915 -- 23 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 6 / 261599   26 / 7554651 -- 6 / 261599 0 / 2128 26 / 7554651 --
cartilage 4 / 266 -- -- -- 4 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 13 / 233710   1 / 56549 -- 13 / 233710 0 / 43127
cerebrum 4 / 228104 -- -- -- 4 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 14 / 51804   -- -- 14 / 51804 0 / 689 -- --
ear 9 / 39315 -- -- -- 9 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 122 / 718928   329 / 2760977 -- 122 / 718928 0 / 9837 329 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 30 / 211918 -- -- -- 30 / 211918 --
eye 34 / 94929 --   -- 34 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 10 / 34979 -- 29 / 548222 -- 10 / 34979 -- 29 / 548222 --
heart 15 / 49793 -- 36 / 1231698 -- 15 / 49793 -- 36 / 1231698 --
kidney 9 / 121184   46 / 1415985 -- 9 / 121184 0 / 2215 46 / 1415985 --
limb 16 / 16187 -- 129 / 595880 -- 16 / 16187 -- 129 / 595880 --
liver 18 / 104633 1 / 6685 15 / 527425 -- 18 / 104633 1 / 6685 15 / 527425 --
lung 3 / 26861 6 / 72516 29 / 943009 -- 3 / 26861 6 / 72516 29 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 143 / 344354 -- 1 / 14648 -- 143 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 43 / 85464 86 / 216846 589 / 960632 9 / 178606 43 / 85464 86 / 216846 589 / 960632 9 / 178606
muscle 11 / 24130 -- 38 / 137075 -- 11 / 24130 -- 38 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary 4 / 43149 -- 137 / 354066 -- 4 / 43149 -- 137 / 354066 --
pancreas 43 / 75220   154 / 1338446 -- 43 / 75220 0 / 34 154 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland 4 / 3907 -- -- -- 4 / 3907 -- -- --
pituitary gland 9 / 17986 -- 28 / 145854 -- 9 / 17986 -- 28 / 145854 --
placenta 31 / 37653 -- 23 / 292212 -- 31 / 37653 -- 23 / 292212 --
pooled tissue 27 / 99675 -- -- -- 27 / 99675 -- -- --
prostate 26 / 23701   268 / 386047 -- 26 / 23701 0 / 5 268 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 10 / 85891   251 / 615945 7 / 57574 10 / 85891 0 / 31511 251 / 615945 7 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 22 / 73492   21 / 386635 -- 22 / 73492 0 / 17831 21 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 6 / 21241 -- 38 / 218318 -- 6 / 21241 -- 38 / 218318 --
synovium 4 / 16875 -- -- -- 4 / 16875 -- -- --
testis 22 / 116987   269 / 736319 -- 22 / 116987 0 / 2634 269 / 736319 --
thymus 1 / 100203   81 / 346181 -- 1 / 100203 0 / 20273 81 / 346181 --
thyroid 3 / 8821 -- -- -- 3 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 109 / 262740     -- 109 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 198 / 206823 -- 2 / 6854 -- 198 / 206823 --
vascular 5 / 12366 -- 95 / 1092595 -- 5 / 12366 -- 95 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 33 / 531904   -- -- 33 / 531904 0 / 212613