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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.55143Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 426 / 3259021 33 / 403641 782 / 25718729 6 / 491920 426 / 3259021 33 / 403641 782 / 25718729 6 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 29 / 261599   276 / 7554651 -- 29 / 261599 0 / 2128 276 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 --   1 / 43127 1 / 56549 -- 0 / 233710 1 / 43127
cerebrum 100 / 228104 -- -- -- 100 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804   -- -- 3 / 51804 0 / 689 -- --
ear 3 / 39315 -- -- -- 3 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 41 / 718928   54 / 2760977 -- 41 / 718928 0 / 9837 54 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 114 / 94929 -- 3 / 138066 -- 114 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 6 / 548222 -- 1 / 34979 -- 6 / 548222 --
heart 8 / 49793 -- 47 / 1231698 -- 8 / 49793 -- 47 / 1231698 --
kidney     14 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 14 / 1415985 --
limb   -- 10 / 595880 -- 0 / 16187 -- 10 / 595880 --
liver 3 / 104633     -- 3 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung 2 / 26861 3 / 72516 12 / 943009 -- 2 / 26861 3 / 72516 12 / 943009 --
lymph node   -- 4 / 344354 -- 0 / 14648 -- 4 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   5 / 216846 3 / 960632 5 / 178606 0 / 85464 5 / 216846 3 / 960632 5 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 1 / 354066 -- 1 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   6 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 6 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 2 / 292212 -- 1 / 37653 -- 2 / 292212 --
pooled tissue 8 / 99675 -- -- -- 8 / 99675 -- -- --
prostate     6 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 6 / 386047 --
retina 43 / 82470 -- 288 / 636203 -- 43 / 82470 -- 288 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 11 / 85891 25 / 31511 9 / 615945   11 / 85891 25 / 31511 9 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     7 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 7 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 3 / 218318 -- 1 / 21241 -- 3 / 218318 --
synovium 17 / 16875 -- -- -- 17 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987   2 / 736319 -- 3 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus 1 / 100203   1 / 346181 -- 1 / 100203 0 / 20273 1 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 22 / 262740     -- 22 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular 5 / 12366 -- 19 / 1092595 -- 5 / 12366 -- 19 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 6 / 531904   -- -- 6 / 531904 0 / 212613