Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.53687Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 110 / 3259021 17 / 403641 488 / 25718729 12 / 491920 110 / 3259021 17 / 403641 488 / 25718729 12 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 1 / 100926 -- 2 / 103390 -- 1 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 31 / 261599   252 / 7554651 -- 31 / 261599 0 / 2128 252 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 7 / 233710   1 / 56549 -- 7 / 233710 0 / 43127
cerebrum 10 / 228104 -- -- -- 10 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 28 / 718928   36 / 2760977 -- 28 / 718928 0 / 9837 36 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 14 / 211918 -- -- -- 14 / 211918 --
eye 2 / 94929 -- 2 / 138066 -- 2 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 16 / 548222 -- 1 / 34979 -- 16 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 5 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 5 / 1231698 --
kidney     3 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 3 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 20 / 595880 -- 1 / 16187 -- 20 / 595880 --
liver     2 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 2 / 527425 --
lung 2 / 26861 3 / 72516 15 / 943009 -- 2 / 26861 3 / 72516 15 / 943009 --
lymph node 7 / 14648 -- 15 / 344354 -- 7 / 14648 -- 15 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 10 / 216846 6 / 960632 3 / 178606 1 / 85464 10 / 216846 6 / 960632 3 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 4 / 35780 -- -- -- 4 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas     19 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 19 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 --   -- 1 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 12 / 636203 -- 1 / 82470 -- 12 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891 3 / 31511 17 / 615945 2 / 57574 1 / 85891 3 / 31511 17 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 8 / 73492   6 / 386635 -- 8 / 73492 0 / 17831 6 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 5 / 218318 -- 1 / 21241 -- 5 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   1 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus     3 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 3 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 4 / 262740 1 / 14058   -- 4 / 262740 1 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 3 / 206823 -- 0 / 6854 -- 3 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 13 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 13 / 1092595 --
white blood cells -- -- 8 / 398838 -- -- -- 8 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904 7 / 212613 -- -- 2 / 531904 7 / 212613