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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.5031Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 219 / 3259021 25 / 403641 1048 / 25718729 55 / 491920 219 / 3259021 25 / 403641 1048 / 25718729 55 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 5 / 38915 -- 1 / 64924 -- 5 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 3 / 100926 -- 9 / 103390 -- 3 / 100926 -- 9 / 103390 --
brain 28 / 261599   186 / 7554651 -- 28 / 261599 0 / 2128 186 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 15 / 56549 -- 12 / 233710   15 / 56549 -- 12 / 233710 0 / 43127
cerebrum 11 / 228104 -- -- -- 11 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804 1 / 689 -- -- 1 / 51804 1 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 39 / 718928   87 / 2760977 -- 39 / 718928 0 / 9837 87 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 2 / 138066 -- 3 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 -- 17 / 548222 -- 2 / 34979 -- 17 / 548222 --
heart 5 / 49793 -- 39 / 1231698 -- 5 / 49793 -- 39 / 1231698 --
kidney 3 / 121184   55 / 1415985 -- 3 / 121184 0 / 2215 55 / 1415985 --
limb   -- 7 / 595880 -- 0 / 16187 -- 7 / 595880 --
liver 1 / 104633 1 / 6685 20 / 527425 -- 1 / 104633 1 / 6685 20 / 527425 --
lung 1 / 26861 2 / 72516 41 / 943009 -- 1 / 26861 2 / 72516 41 / 943009 --
lymph node   -- 36 / 344354 -- 0 / 14648 -- 36 / 344354 --
lymphoreticular   1 / 5421 -- -- 0 / 3137 1 / 5421 -- --
mammary gland 15 / 85464 17 / 216846 86 / 960632 42 / 178606 15 / 85464 17 / 216846 86 / 960632 42 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 5 / 137075 -- 2 / 24130 -- 5 / 137075 --
nervous 6 / 35780 -- -- -- 6 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 7 / 354066 -- 1 / 43149 -- 7 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   46 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 46 / 1338446 --
pancreatic islet 3 / 30771 -- -- -- 3 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 4 / 145854 -- 1 / 17986 -- 4 / 145854 --
placenta 3 / 37653 -- 46 / 292212 -- 3 / 37653 -- 46 / 292212 --
pooled tissue 5 / 99675 -- -- -- 5 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   19 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 19 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 19 / 636203 -- 1 / 82470 -- 19 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434   -- -- 2 / 18434 0 / 958 -- --
skin 4 / 85891   98 / 615945 5 / 57574 4 / 85891 0 / 31511 98 / 615945 5 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 3 / 73492 2 / 17831 37 / 386635 -- 3 / 73492 2 / 17831 37 / 386635 --
stem cell -- -- 7 / 234473 -- -- -- 7 / 234473 --
stomach 7 / 21241 -- 9 / 218318 -- 7 / 21241 -- 9 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 2 / 116987   31 / 736319 -- 2 / 116987 0 / 2634 31 / 736319 --
thymus 8 / 100203   16 / 346181 -- 8 / 100203 0 / 20273 16 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 22 / 262740 1 / 14058 1 / 25954 -- 22 / 262740 1 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 6 / 206823 -- 0 / 6854 -- 6 / 206823 --
vascular 7 / 12366 -- 46 / 1092595 -- 7 / 12366 -- 46 / 1092595 --
white blood cells -- -- 20 / 398838 -- -- -- 20 / 398838 --
whole body -- -- 32 / 531904 8 / 212613 -- -- 32 / 531904 8 / 212613