Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.5027Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 216 / 3259021 36 / 403641 360 / 25718729 5 / 491920 216 / 3259021 36 / 403641 360 / 25718729 5 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 2 / 64924 -- 0 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow 5 / 100926 -- 3 / 103390 -- 5 / 100926 -- 3 / 103390 --
brain 29 / 261599 3 / 2128 7 / 7554651 -- 29 / 261599 3 / 2128 7 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 --     5 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 14 / 228104 -- -- -- 14 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 37 / 718928   13 / 2760977 -- 37 / 718928 0 / 9837 13 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 3 / 94929 -- 2 / 138066 -- 3 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 9 / 548222 -- 0 / 34979 -- 9 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 21 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 21 / 1231698 --
kidney 12 / 121184 1 / 2215 15 / 1415985 -- 12 / 121184 1 / 2215 15 / 1415985 --
limb   -- 4 / 595880 -- 0 / 16187 -- 4 / 595880 --
liver 2 / 104633   19 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 19 / 527425 --
lung 3 / 26861 9 / 72516 25 / 943009 -- 3 / 26861 9 / 72516 25 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 4 / 344354 -- 1 / 14648 -- 4 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 15 / 216846 23 / 960632 2 / 178606 4 / 85464 15 / 216846 23 / 960632 2 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 1 / 137075 -- 1 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 5 / 43149 -- 2 / 354066 -- 5 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas     12 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 12 / 1338446 --
pancreatic islet 4 / 30771 -- -- -- 4 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 1 / 292212 -- 1 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 13 / 99675 -- -- -- 13 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   4 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 4 / 386047 --
retina 12 / 82470 -- 2 / 636203 -- 12 / 82470 -- 2 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 7 / 85891 7 / 31511 5 / 615945 3 / 57574 7 / 85891 7 / 31511 5 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 5 / 73492   13 / 386635 -- 5 / 73492 0 / 17831 13 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 6 / 218318 -- 0 / 21241 -- 6 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     11 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 11 / 736319 --
thymus 9 / 100203   8 / 346181 -- 9 / 100203 0 / 20273 8 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 33 / 262740 1 / 14058 3 / 25954 -- 33 / 262740 1 / 14058 3 / 25954 --
uterus   -- 5 / 206823 -- 0 / 6854 -- 5 / 206823 --
vascular 3 / 12366 -- 129 / 1092595 -- 3 / 12366 -- 129 / 1092595 --
white blood cells -- -- 4 / 398838 -- -- -- 4 / 398838 --
whole body -- -- 7 / 531904   -- -- 7 / 531904 0 / 212613