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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.4974Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 390 / 3259021 5 / 403641 1479 / 25718729   390 / 3259021 5 / 403641 1479 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 -- 2 / 64924 -- 3 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow 43 / 100926 --   -- 43 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 82 / 261599   1209 / 7554651 -- 82 / 261599 0 / 2128 1209 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 13 / 56549 -- 4 / 233710   13 / 56549 -- 4 / 233710 0 / 43127
cerebrum 34 / 228104 -- -- -- 34 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 7 / 39315 -- -- -- 7 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 51 / 718928   56 / 2760977 -- 51 / 718928 0 / 9837 56 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 4 / 211918 -- -- -- 4 / 211918 --
eye 23 / 94929 --   -- 23 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 -- 15 / 548222 -- 2 / 34979 -- 15 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 9 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 9 / 1231698 --
kidney 14 / 121184   24 / 1415985 -- 14 / 121184 0 / 2215 24 / 1415985 --
limb   -- 8 / 595880 -- 0 / 16187 -- 8 / 595880 --
liver     3 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung   2 / 72516 1 / 943009 -- 0 / 26861 2 / 72516 1 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   3 / 216846 4 / 960632   0 / 85464 3 / 216846 4 / 960632 0 / 178606
muscle 3 / 24130 -- 4 / 137075 -- 3 / 24130 -- 4 / 137075 --
nervous 11 / 35780 -- -- -- 11 / 35780 -- -- --
ovary 4 / 43149 -- 14 / 354066 -- 4 / 43149 -- 14 / 354066 --
pancreas 10 / 75220   35 / 1338446 -- 10 / 75220 0 / 34 35 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 15 / 9981 -- -- -- 15 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 4 / 145854 -- 1 / 17986 -- 4 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 6 / 292212 -- 1 / 37653 -- 6 / 292212 --
pooled tissue 13 / 99675 -- -- -- 13 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   6 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 6 / 386047 --
retina 24 / 82470 -- 11 / 636203 -- 24 / 82470 -- 11 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 4 / 85891   8 / 615945   4 / 85891 0 / 31511 8 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     6 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 6 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 9 / 218318 -- 1 / 21241 -- 9 / 218318 --
synovium 4 / 16875 -- -- -- 4 / 16875 -- -- --
testis 5 / 116987   14 / 736319 -- 5 / 116987 0 / 2634 14 / 736319 --
thymus 1 / 100203     -- 1 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 15 / 262740     -- 15 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 14 / 206823 -- 1 / 6854 -- 14 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 8 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 8 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613