Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.490358Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 227 / 3259021 51 / 403641 385 / 25718729 17 / 491920 227 / 3259021 51 / 403641 385 / 25718729 17 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 -- 2 / 64924 -- 1 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow 4 / 100926 -- 13 / 103390 -- 4 / 100926 -- 13 / 103390 --
brain 34 / 261599   30 / 7554651 -- 34 / 261599 0 / 2128 30 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 5 / 233710   1 / 56549 -- 5 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 6 / 39315 -- -- -- 6 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 57 / 718928   42 / 2760977 -- 57 / 718928 0 / 9837 42 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 4 / 94929 --   -- 4 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 5 / 548222 -- 0 / 34979 -- 5 / 548222 --
heart 5 / 49793 -- 13 / 1231698 -- 5 / 49793 -- 13 / 1231698 --
kidney 1 / 121184 11 / 2215 20 / 1415985 -- 1 / 121184 11 / 2215 20 / 1415985 --
limb   -- 7 / 595880 -- 0 / 16187 -- 7 / 595880 --
liver 3 / 104633   2 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 2 / 527425 --
lung 1 / 26861 8 / 72516 9 / 943009 -- 1 / 26861 8 / 72516 9 / 943009 --
lymph node   -- 2 / 344354 -- 0 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 7 / 85464 18 / 216846 48 / 960632 1 / 178606 7 / 85464 18 / 216846 48 / 960632 1 / 178606
muscle   -- 4 / 137075 -- 0 / 24130 -- 4 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 4 / 354066 -- 0 / 43149 -- 4 / 354066 --
pancreas 7 / 75220   14 / 1338446 -- 7 / 75220 0 / 34 14 / 1338446 --
pancreatic islet 6 / 30771 -- -- -- 6 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 --   -- 1 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 21 / 37653 -- 1 / 292212 -- 21 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     2 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 2 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 10 / 636203 -- 1 / 82470 -- 10 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 9 / 85891 8 / 31511 7 / 615945 3 / 57574 9 / 85891 8 / 31511 7 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492   3 / 386635 -- 2 / 73492 0 / 17831 3 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach 10 / 21241 -- 1 / 218318 -- 10 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 2 / 116987   5 / 736319 -- 2 / 116987 0 / 2634 5 / 736319 --
thymus 2 / 100203   2 / 346181 -- 2 / 100203 0 / 20273 2 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 35 / 262740 6 / 14058 3 / 25954 -- 35 / 262740 6 / 14058 3 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 1 / 206823 -- 2 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 113 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 113 / 1092595 --
white blood cells -- -- 8 / 398838 -- -- -- 8 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904 13 / 212613 -- -- 4 / 531904 13 / 212613