Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.490344Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 225 / 3259021 20 / 403641 350 / 25718729 4 / 491920 225 / 3259021 20 / 403641 350 / 25718729 4 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 -- 1 / 64924 -- 1 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow 8 / 100926 -- 1 / 103390 -- 8 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 36 / 261599   181 / 7554651 -- 36 / 261599 0 / 2128 181 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 19 / 56549 -- 6 / 233710   19 / 56549 -- 6 / 233710 0 / 43127
cerebrum 15 / 228104 -- -- -- 15 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 4 / 39315 -- -- -- 4 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 46 / 718928   28 / 2760977 -- 46 / 718928 0 / 9837 28 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 5 / 94929 --   -- 5 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 5 / 548222 -- 0 / 34979 -- 5 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 10 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 10 / 1231698 --
kidney 2 / 121184   35 / 1415985 -- 2 / 121184 0 / 2215 35 / 1415985 --
limb   -- 2 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver 1 / 104633   7 / 527425 -- 1 / 104633 0 / 6685 7 / 527425 --
lung 1 / 26861 10 / 72516 7 / 943009 -- 1 / 26861 10 / 72516 7 / 943009 --
lymph node   -- 2 / 344354 -- 0 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 6 / 216846 15 / 960632 2 / 178606 4 / 85464 6 / 216846 15 / 960632 2 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary   -- 1 / 354066 -- 0 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas     9 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 9 / 1338446 --
pancreatic islet 8 / 30771 -- -- -- 8 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 5 / 9981 -- -- -- 5 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 5 / 17986 -- 1 / 145854 -- 5 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 1 / 37653 --   -- 1 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 6 / 99675 -- -- -- 6 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   7 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 7 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 6 / 636203 -- 4 / 82470 -- 6 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 11 / 85891 2 / 31511 1 / 615945 1 / 57574 11 / 85891 2 / 31511 1 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 2 / 73492 2 / 17831 1 / 386635 -- 2 / 73492 2 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 6 / 218318 -- 1 / 21241 -- 6 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 2 / 116987   2 / 736319 -- 2 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus 11 / 100203   4 / 346181 -- 11 / 100203 0 / 20273 4 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 20 / 262740     -- 20 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 -- 1 / 206823 -- 1 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 5 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 5 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904 1 / 212613 -- -- 4 / 531904 1 / 212613