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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.489675Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 387 / 3259021 1 / 403641 1161 / 25718729 13 / 491920 387 / 3259021 1 / 403641 1161 / 25718729 13 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 3 / 64924 -- 0 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 69 / 261599   993 / 7554651 -- 69 / 261599 0 / 2128 993 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 4 / 233710 8 / 43127 0 / 56549 -- 4 / 233710 8 / 43127
cerebrum 196 / 228104 -- -- -- 196 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 30 / 718928   36 / 2760977 -- 30 / 718928 0 / 9837 36 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1 / 211918 -- -- -- 1 / 211918 --
eye 9 / 94929 --   -- 9 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 2 / 548222 -- 0 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart   -- 10 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 10 / 1231698 --
kidney     7 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 7 / 1415985 --
limb 4 / 16187 -- 4 / 595880 -- 4 / 16187 -- 4 / 595880 --
liver 2 / 104633   1 / 527425 -- 2 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung 1 / 26861   13 / 943009 -- 1 / 26861 0 / 72516 13 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   1 / 216846 14 / 960632 2 / 178606 0 / 85464 1 / 216846 14 / 960632 2 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 10 / 43149 -- 1 / 354066 -- 10 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas     7 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 7 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 5 / 17986 --   -- 5 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 12 / 99675 -- -- -- 12 / 99675 -- -- --
prostate     2 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 2 / 386047 --
retina 22 / 82470 -- 38 / 636203 -- 22 / 82470 -- 38 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     4 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 4 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     1 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 11 / 116987   9 / 736319 -- 11 / 116987 0 / 2634 9 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 12 / 262740     -- 12 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 3 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 3 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904 3 / 212613 -- -- 4 / 531904 3 / 212613