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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.489660Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 232 / 3259021 28 / 403641 1211 / 25718729 10 / 491920 232 / 3259021 28 / 403641 1211 / 25718729 10 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 -- 4 / 64924 -- 1 / 38915 -- 4 / 64924 --
bone marrow   -- 1 / 103390 -- 0 / 100926 -- 1 / 103390 --
brain 26 / 261599 4 / 2128 728 / 7554651 -- 26 / 261599 4 / 2128 728 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 -- 4 / 233710 2 / 43127 5 / 56549 -- 4 / 233710 2 / 43127
cerebrum 48 / 228104 -- -- -- 48 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 6 / 39315 -- -- -- 6 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 26 / 718928   47 / 2760977 -- 26 / 718928 0 / 9837 47 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 7 / 211918 -- -- -- 7 / 211918 --
eye 7 / 94929 -- 2 / 138066 -- 7 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 14 / 548222 -- 1 / 34979 -- 14 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 17 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 17 / 1231698 --
kidney 1 / 121184   17 / 1415985 -- 1 / 121184 0 / 2215 17 / 1415985 --
limb 11 / 16187 -- 20 / 595880 -- 11 / 16187 -- 20 / 595880 --
liver 7 / 104633   13 / 527425 -- 7 / 104633 0 / 6685 13 / 527425 --
lung   9 / 72516 25 / 943009 -- 0 / 26861 9 / 72516 25 / 943009 --
lymph node   -- 4 / 344354 -- 0 / 14648 -- 4 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 10 / 85464 6 / 216846 44 / 960632 3 / 178606 10 / 85464 6 / 216846 44 / 960632 3 / 178606
muscle   -- 4 / 137075 -- 0 / 24130 -- 4 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary   -- 5 / 354066 -- 0 / 43149 -- 5 / 354066 --
pancreas 5 / 75220   28 / 1338446 -- 5 / 75220 0 / 34 28 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 9 / 145854 -- 1 / 17986 -- 9 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 11 / 292212 -- 1 / 37653 -- 11 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   17 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 17 / 386047 --
retina 5 / 82470 -- 28 / 636203 -- 5 / 82470 -- 28 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 14 / 85891 4 / 31511 36 / 615945 1 / 57574 14 / 85891 4 / 31511 36 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 8 / 73492   6 / 386635 -- 8 / 73492 0 / 17831 6 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 2 / 218318 -- 2 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 10 / 116987   36 / 736319 -- 10 / 116987 0 / 2634 36 / 736319 --
thymus 2 / 100203 5 / 20273 7 / 346181 -- 2 / 100203 5 / 20273 7 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 18 / 262740   1 / 25954 -- 18 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus   -- 4 / 206823 -- 0 / 6854 -- 4 / 206823 --
vascular   -- 44 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 44 / 1092595 --
white blood cells -- -- 6 / 398838 -- -- -- 6 / 398838 --
whole body -- -- 18 / 531904 4 / 212613 -- -- 18 / 531904 4 / 212613