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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.489639Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 317 / 3259021 35 / 403641 19 / 25718729   317 / 3259021 35 / 403641 19 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 29 / 100926 --   -- 29 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 11 / 261599   3 / 7554651 -- 11 / 261599 0 / 2128 3 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 4 / 56549 -- 1 / 233710   4 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 12 / 228104 -- -- -- 12 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 6 / 51804   -- -- 6 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 93 / 718928   5 / 2760977 -- 93 / 718928 0 / 9837 5 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 2 / 94929 --   -- 2 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 --   -- 2 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart 4 / 49793 -- 1 / 1231698 -- 4 / 49793 -- 1 / 1231698 --
kidney 7 / 121184   1 / 1415985 -- 7 / 121184 0 / 2215 1 / 1415985 --
limb   -- 2 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver 3 / 104633 2 / 6685   -- 3 / 104633 2 / 6685 0 / 527425 --
lung 4 / 26861 9 / 72516   -- 4 / 26861 9 / 72516 0 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 --   -- 1 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 6 / 85464 20 / 216846     6 / 85464 20 / 216846 0 / 960632 0 / 178606
muscle 2 / 24130 --   -- 2 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 6 / 35780 -- -- -- 6 / 35780 -- -- --
ovary 7 / 43149 --   -- 7 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   2 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 2 / 1338446 --
pancreatic islet 2 / 30771 -- -- -- 2 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 1 / 37653 --   -- 1 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 10 / 99675 -- -- -- 10 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701     -- 2 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 3 / 82470 --   -- 3 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 19 / 85891   1 / 615945   19 / 85891 0 / 31511 1 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492 1 / 17831   -- 4 / 73492 1 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 2 / 21241 -- 2 / 218318 -- 2 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 18 / 116987 1 / 2634   -- 18 / 116987 1 / 2634 0 / 736319 --
thymus 12 / 100203     -- 12 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 31 / 262740 2 / 14058   -- 31 / 262740 2 / 14058 0 / 25954 --
uterus 1 / 6854 --   -- 1 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 1 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 1 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613