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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.489612Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 189 / 3259021 21 / 403641 295 / 25718729 15 / 491920 189 / 3259021 21 / 403641 295 / 25718729 15 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 --   -- 3 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 2 / 100926 -- 3 / 103390 -- 2 / 100926 -- 3 / 103390 --
brain 29 / 261599   106 / 7554651 -- 29 / 261599 0 / 2128 106 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 8 / 233710   1 / 56549 -- 8 / 233710 0 / 43127
cerebrum 14 / 228104 -- -- -- 14 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 2 / 51804   -- -- 2 / 51804 0 / 689 -- --
ear 10 / 39315 -- -- -- 10 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 32 / 718928   18 / 2760977 -- 32 / 718928 0 / 9837 18 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 6 / 94929 -- 1 / 138066 -- 6 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 7 / 548222 -- 0 / 34979 -- 7 / 548222 --
heart 3 / 49793 -- 11 / 1231698 -- 3 / 49793 -- 11 / 1231698 --
kidney 21 / 121184   14 / 1415985 -- 21 / 121184 0 / 2215 14 / 1415985 --
limb   -- 7 / 595880 -- 0 / 16187 -- 7 / 595880 --
liver 4 / 104633   8 / 527425 -- 4 / 104633 0 / 6685 8 / 527425 --
lung 1 / 26861 3 / 72516 11 / 943009 -- 1 / 26861 3 / 72516 11 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 7 / 85464 8 / 216846 10 / 960632 4 / 178606 7 / 85464 8 / 216846 10 / 960632 4 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 8 / 354066 -- 1 / 43149 -- 8 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   14 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 14 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 -- 1 / 145854 -- 3 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 1 / 292212 -- 2 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   1 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina 4 / 82470 -- 11 / 636203 -- 4 / 82470 -- 11 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434 1 / 958 -- -- 2 / 18434 1 / 958 -- --
skin 6 / 85891   5 / 615945 1 / 57574 6 / 85891 0 / 31511 5 / 615945 1 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 8 / 73492 2 / 17831 1 / 386635 -- 8 / 73492 2 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 5 / 21241 -- 3 / 218318 -- 5 / 21241 -- 3 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 5 / 116987   12 / 736319 -- 5 / 116987 0 / 2634 12 / 736319 --
thymus 3 / 100203 2 / 20273 4 / 346181 -- 3 / 100203 2 / 20273 4 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 3 / 262740 5 / 14058   -- 3 / 262740 5 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 9 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 9 / 1092595 --
white blood cells -- -- 16 / 398838 -- -- -- 16 / 398838 --
whole body -- -- 5 / 531904 10 / 212613 -- -- 5 / 531904 10 / 212613