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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.489602Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 445 / 3259021 122 / 403641     445 / 3259021 122 / 403641 0 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 67 / 100926 --   -- 67 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 16 / 261599     -- 16 / 261599 0 / 2128 0 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 15 / 228104 -- -- -- 15 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804 1 / 689 -- -- 3 / 51804 1 / 689 -- --
ear 3 / 39315 -- -- -- 3 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 159 / 718928 8 / 9837   -- 159 / 718928 8 / 9837 0 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 4 / 94929 --   -- 4 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 9 / 34979 --   -- 9 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart 4 / 49793 --   -- 4 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney 8 / 121184     -- 8 / 121184 0 / 2215 0 / 1415985 --
limb 1 / 16187 --   -- 1 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver 9 / 104633     -- 9 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung 2 / 26861 8 / 72516   -- 2 / 26861 8 / 72516 0 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular 2 / 3137 11 / 5421 -- -- 2 / 3137 11 / 5421 -- --
mammary gland 12 / 85464 27 / 216846     12 / 85464 27 / 216846 0 / 960632 0 / 178606
muscle 5 / 24130 --   -- 5 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 --   -- 3 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 4 / 75220     -- 4 / 75220 0 / 34 0 / 1338446 --
pancreatic islet 3 / 30771 -- -- -- 3 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 1 / 37653 --   -- 1 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 26 / 99675 -- -- -- 26 / 99675 -- -- --
prostate 4 / 23701     -- 4 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 8 / 82470 --   -- 8 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 8 / 85891       8 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 8 / 73492 22 / 17831   -- 8 / 73492 22 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 3 / 21241 --   -- 3 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium 2 / 16875 -- -- -- 2 / 16875 -- -- --
testis 25 / 116987     -- 25 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus 8 / 100203 44 / 20273   -- 8 / 100203 44 / 20273 0 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 20 / 262740 1 / 14058   -- 20 / 262740 1 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   --   -- 0 / 12366 -- 0 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613