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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.467412Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 3593 / 3259021 72 / 403641 120173 / 25718729 752 / 491920 3593 / 3259021 72 / 403641 120173 / 25718729 752 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 7510 / 64924 -- 2 / 38915 -- 7510 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 88 / 261599   12538 / 7554651 -- 88 / 261599 0 / 2128 12538 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 9 / 56549 -- 78 / 233710 51 / 43127 9 / 56549 -- 78 / 233710 51 / 43127
cerebrum 31 / 228104 -- -- -- 31 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 7 / 39315 -- -- -- 7 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 1607 / 718928 1 / 9837 3794 / 2760977 -- 1607 / 718928 1 / 9837 3794 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1306 / 211918 -- -- -- 1306 / 211918 --
eye 135 / 94929 -- 526 / 138066 -- 135 / 94929 -- 526 / 138066 --
gastrointestinal tract 1 / 34979 -- 746 / 548222 -- 1 / 34979 -- 746 / 548222 --
heart 113 / 49793 -- 2058 / 1231698 -- 113 / 49793 -- 2058 / 1231698 --
kidney 45 / 121184   4170 / 1415985 -- 45 / 121184 0 / 2215 4170 / 1415985 --
limb 31 / 16187 -- 3354 / 595880 -- 31 / 16187 -- 3354 / 595880 --
liver 893 / 104633   21567 / 527425 -- 893 / 104633 0 / 6685 21567 / 527425 --
lung 40 / 26861 2 / 72516 10345 / 943009 -- 40 / 26861 2 / 72516 10345 / 943009 --
lymph node 10 / 14648 -- 379 / 344354 -- 10 / 14648 -- 379 / 344354 --
lymphoreticular   4 / 5421 -- -- 0 / 3137 4 / 5421 -- --
mammary gland 25 / 85464 2 / 216846 1073 / 960632 622 / 178606 25 / 85464 2 / 216846 1073 / 960632 622 / 178606
muscle 5 / 24130 -- 571 / 137075 -- 5 / 24130 -- 571 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 12 / 43149 -- 2870 / 354066 -- 12 / 43149 -- 2870 / 354066 --
pancreas 69 / 75220   4893 / 1338446 -- 69 / 75220 0 / 34 4893 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 12 / 3907 -- -- -- 12 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 -- 713 / 145854 -- 3 / 17986 -- 713 / 145854 --
placenta 98 / 37653 -- 1737 / 292212 -- 98 / 37653 -- 1737 / 292212 --
pooled tissue 81 / 99675 -- -- -- 81 / 99675 -- -- --
prostate     269 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 269 / 386047 --
retina 7 / 82470 -- 125 / 636203 -- 7 / 82470 -- 125 / 636203 --
salivary gland 2 / 18434   -- -- 2 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891   2355 / 615945 78 / 57574 1 / 85891 0 / 31511 2355 / 615945 78 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 111 / 73492 63 / 17831 11089 / 386635 -- 111 / 73492 63 / 17831 11089 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach 13 / 21241 -- 820 / 218318 -- 13 / 21241 -- 820 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 6 / 116987   3327 / 736319 -- 6 / 116987 0 / 2634 3327 / 736319 --
thymus 31 / 100203   4971 / 346181 -- 31 / 100203 0 / 20273 4971 / 346181 --
thyroid 7 / 8821 -- -- -- 7 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 94 / 262740     -- 94 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 264 / 206823 -- 0 / 6854 -- 264 / 206823 --
vascular 1 / 12366 -- 500 / 1092595 -- 1 / 12366 -- 500 / 1092595 --
white blood cells -- -- 20 / 398838 -- -- -- 20 / 398838 --
whole body -- -- 16204 / 531904 1 / 212613 -- -- 16204 / 531904 1 / 212613