Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.466951Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 9 / 3259021   4362 / 25718729 73 / 491920 9 / 3259021 0 / 403641 4362 / 25718729 73 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 8 / 64924 -- 0 / 38915 -- 8 / 64924 --
bone marrow   -- 12 / 103390 -- 0 / 100926 -- 12 / 103390 --
brain     1275 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 1275 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 47 / 233710 8 / 43127 0 / 56549 -- 47 / 233710 8 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 6 / 718928   844 / 2760977 -- 6 / 718928 0 / 9837 844 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 12 / 211918 -- -- -- 12 / 211918 --
eye   -- 23 / 138066 -- 0 / 94929 -- 23 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 76 / 548222 -- 0 / 34979 -- 76 / 548222 --
heart   -- 161 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 161 / 1231698 --
kidney     161 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 161 / 1415985 --
limb   -- 56 / 595880 -- 0 / 16187 -- 56 / 595880 --
liver     39 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 39 / 527425 --
lung     135 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 135 / 943009 --
lymph node   -- 38 / 344354 -- 0 / 14648 -- 38 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     102 / 960632 9 / 178606 0 / 85464 0 / 216846 102 / 960632 9 / 178606
muscle   -- 8 / 137075 -- 0 / 24130 -- 8 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 43 / 354066 -- 0 / 43149 -- 43 / 354066 --
pancreas     185 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 185 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 7 / 145854 -- 0 / 17986 -- 7 / 145854 --
placenta   -- 32 / 292212 -- 0 / 37653 -- 32 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate     20 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 20 / 386047 --
retina   -- 161 / 636203 -- 0 / 82470 -- 161 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     41 / 615945 24 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 41 / 615945 24 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     27 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 27 / 386635 --
stem cell -- -- 74 / 234473 -- -- -- 74 / 234473 --
stomach   -- 20 / 218318 -- 0 / 21241 -- 20 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 2 / 116987   130 / 736319 -- 2 / 116987 0 / 2634 130 / 736319 --
thymus 1 / 100203   56 / 346181 -- 1 / 100203 0 / 20273 56 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue     4 / 25954 -- 0 / 262740 0 / 14058 4 / 25954 --
uterus   -- 22 / 206823 -- 0 / 6854 -- 22 / 206823 --
vascular   -- 312 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 312 / 1092595 --
white blood cells -- -- 83 / 398838 -- -- -- 83 / 398838 --
whole body -- -- 148 / 531904 32 / 212613 -- -- 148 / 531904 32 / 212613