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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.466882Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 12 / 3259021   127 / 25718729   12 / 3259021 0 / 403641 127 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain     13 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 13 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804   -- -- 3 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 1 / 718928   3 / 2760977 -- 1 / 718928 0 / 9837 3 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye   --   -- 0 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 -- 28 / 548222 -- 2 / 34979 -- 28 / 548222 --
heart   -- 6 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 6 / 1231698 --
kidney       -- 0 / 121184 0 / 2215 0 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver     5 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 5 / 527425 --
lung     20 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 20 / 943009 --
lymph node   -- 1 / 344354 -- 0 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464   1 / 960632   1 / 85464 0 / 216846 1 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas     22 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 22 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 2 / 145854 -- 0 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin         0 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 1 / 218318 -- 0 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     2 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus 1 / 100203   11 / 346181 -- 1 / 100203 0 / 20273 11 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue       -- 0 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus 3 / 6854 --   -- 3 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 1 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 1 / 1092595 --
white blood cells -- -- 3 / 398838 -- -- -- 3 / 398838 --
whole body -- -- 5 / 531904   -- -- 5 / 531904 0 / 212613