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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.466344Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 160 / 3259021   240 / 25718729   160 / 3259021 0 / 403641 240 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 --   -- 1 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 42 / 261599   139 / 7554651 -- 42 / 261599 0 / 2128 139 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 6 / 56549 -- 2 / 233710   6 / 56549 -- 2 / 233710 0 / 43127
cerebrum 3 / 228104 -- -- -- 3 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 52 / 718928   37 / 2760977 -- 52 / 718928 0 / 9837 37 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 10 / 94929 -- 2 / 138066 -- 10 / 94929 -- 2 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 12 / 548222 -- 0 / 34979 -- 12 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 3 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 3 / 1231698 --
kidney 2 / 121184   8 / 1415985 -- 2 / 121184 0 / 2215 8 / 1415985 --
limb   -- 9 / 595880 -- 0 / 16187 -- 9 / 595880 --
liver     1 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung     8 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 8 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland         0 / 85464 0 / 216846 0 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 3 / 137075 -- 0 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous 10 / 35780 -- -- -- 10 / 35780 -- -- --
ovary   --   -- 0 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 5 / 75220   5 / 1338446 -- 5 / 75220 0 / 34 5 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 4 / 17986 -- 1 / 145854 -- 4 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 1 / 37653 --   -- 1 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina 13 / 82470 -- 3 / 636203 -- 13 / 82470 -- 3 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     1 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 1 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 3 / 218318 -- 0 / 21241 -- 3 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987   1 / 736319 -- 3 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus     1 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 1 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 3 / 262740     -- 3 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 1 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 1 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613