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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.46354Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 253 / 3259021 29 / 403641 381 / 25718729 11 / 491920 253 / 3259021 29 / 403641 381 / 25718729 11 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 63 / 38915 -- 7 / 64924 -- 63 / 38915 -- 7 / 64924 --
bone marrow   -- 7 / 103390 -- 0 / 100926 -- 7 / 103390 --
brain     14 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 14 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 1 / 233710   0 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 18 / 51804   -- -- 18 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 56 / 718928   11 / 2760977 -- 56 / 718928 0 / 9837 11 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 2 / 94929 -- 4 / 138066 -- 2 / 94929 -- 4 / 138066 --
gastrointestinal tract 6 / 34979 -- 8 / 548222 -- 6 / 34979 -- 8 / 548222 --
heart   -- 26 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 26 / 1231698 --
kidney 7 / 121184   29 / 1415985 -- 7 / 121184 0 / 2215 29 / 1415985 --
limb 11 / 16187 -- 4 / 595880 -- 11 / 16187 -- 4 / 595880 --
liver 19 / 104633   50 / 527425 -- 19 / 104633 0 / 6685 50 / 527425 --
lung 2 / 26861 12 / 72516 2 / 943009 -- 2 / 26861 12 / 72516 2 / 943009 --
lymph node   -- 35 / 344354 -- 0 / 14648 -- 35 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   17 / 216846 87 / 960632 9 / 178606 0 / 85464 17 / 216846 87 / 960632 9 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 2 / 43149 --   -- 2 / 43149 -- 0 / 354066 --
pancreas 1 / 75220   13 / 1338446 -- 1 / 75220 0 / 34 13 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   -- 2 / 292212 -- 0 / 37653 -- 2 / 292212 --
pooled tissue 11 / 99675 -- -- -- 11 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   1 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland 4 / 18434   -- -- 4 / 18434 0 / 958 -- --
skin     8 / 615945 2 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 8 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 1 / 73492   2 / 386635 -- 1 / 73492 0 / 17831 2 / 386635 --
stem cell -- -- 7 / 234473 -- -- -- 7 / 234473 --
stomach 4 / 21241 -- 1 / 218318 -- 4 / 21241 -- 1 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     3 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 3 / 736319 --
thymus 14 / 100203   12 / 346181 -- 14 / 100203 0 / 20273 12 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 31 / 262740     -- 31 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 10 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 10 / 1092595 --
white blood cells -- -- 31 / 398838 -- -- -- 31 / 398838 --
whole body -- -- 4 / 531904   -- -- 4 / 531904 0 / 212613