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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.45953Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 557 / 3259021   7580 / 25718729 39 / 491920 557 / 3259021 0 / 403641 7580 / 25718729 39 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 --   -- 1 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 190 / 261599   6699 / 7554651 -- 190 / 261599 0 / 2128 6699 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 40 / 56549 -- 32 / 233710 39 / 43127 40 / 56549 -- 32 / 233710 39 / 43127
cerebrum 149 / 228104 -- -- -- 149 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 11 / 718928   376 / 2760977 -- 11 / 718928 0 / 9837 376 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 13 / 94929 -- 3 / 138066 -- 13 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 5 / 34979 -- 5 / 548222 -- 5 / 34979 -- 5 / 548222 --
heart   -- 50 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 50 / 1231698 --
kidney     10 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 10 / 1415985 --
limb   -- 2 / 595880 -- 0 / 16187 -- 2 / 595880 --
liver     23 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 23 / 527425 --
lung     25 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 25 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     10 / 960632   0 / 85464 0 / 216846 10 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 25 / 35780 -- -- -- 25 / 35780 -- -- --
ovary   -- 4 / 354066 -- 0 / 43149 -- 4 / 354066 --
pancreas     97 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 97 / 1338446 --
pancreatic islet 3 / 30771 -- -- -- 3 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 48 / 9981 -- -- -- 48 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 -- 13 / 145854 -- 3 / 17986 -- 13 / 145854 --
placenta   -- 5 / 292212 -- 0 / 37653 -- 5 / 292212 --
pooled tissue 9 / 99675 -- -- -- 9 / 99675 -- -- --
prostate 1 / 23701   6 / 386047 -- 1 / 23701 0 / 5 6 / 386047 --
retina 42 / 82470 -- 134 / 636203 -- 42 / 82470 -- 134 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     4 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 4 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     6 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 6 / 386635 --
stem cell -- -- 18 / 234473 -- -- -- 18 / 234473 --
stomach   -- 7 / 218318 -- 0 / 21241 -- 7 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     13 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 13 / 736319 --
thymus     6 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 6 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 16 / 262740     -- 16 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   --   -- 0 / 12366 -- 0 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 31 / 531904   -- -- 31 / 531904 0 / 212613