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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.458088Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 413 / 3259021 60 / 403641 73359 / 25718729 827 / 491920 413 / 3259021 60 / 403641 73359 / 25718729 827 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 -- 118 / 64924 -- 2 / 38915 -- 118 / 64924 --
bone marrow 10 / 100926 -- 148 / 103390 -- 10 / 100926 -- 148 / 103390 --
brain 45 / 261599   14670 / 7554651 -- 45 / 261599 0 / 2128 14670 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 567 / 233710 75 / 43127 1 / 56549 -- 567 / 233710 75 / 43127
cerebrum 4 / 228104 -- -- -- 4 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 12 / 51804   -- -- 12 / 51804 0 / 689 -- --
ear 9 / 39315 -- -- -- 9 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 103 / 718928 5 / 9837 11203 / 2760977 -- 103 / 718928 5 / 9837 11203 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 1616 / 211918 -- -- -- 1616 / 211918 --
eye 12 / 94929 -- 584 / 138066 -- 12 / 94929 -- 584 / 138066 --
gastrointestinal tract 5 / 34979 -- 2445 / 548222 -- 5 / 34979 -- 2445 / 548222 --
heart 4 / 49793 -- 4592 / 1231698 -- 4 / 49793 -- 4592 / 1231698 --
kidney 21 / 121184   2756 / 1415985 -- 21 / 121184 0 / 2215 2756 / 1415985 --
limb   -- 3367 / 595880 -- 0 / 16187 -- 3367 / 595880 --
liver 5 / 104633   1080 / 527425 -- 5 / 104633 0 / 6685 1080 / 527425 --
lung 1 / 26861 3 / 72516 3995 / 943009 -- 1 / 26861 3 / 72516 3995 / 943009 --
lymph node 3 / 14648 -- 1096 / 344354 -- 3 / 14648 -- 1096 / 344354 --
lymphoreticular 4 / 3137 3 / 5421 -- -- 4 / 3137 3 / 5421 -- --
mammary gland 7 / 85464 21 / 216846 1756 / 960632 352 / 178606 7 / 85464 21 / 216846 1756 / 960632 352 / 178606
muscle 4 / 24130 -- 448 / 137075 -- 4 / 24130 -- 448 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 4 / 43149 -- 2283 / 354066 -- 4 / 43149 -- 2283 / 354066 --
pancreas 23 / 75220   3522 / 1338446 -- 23 / 75220 0 / 34 3522 / 1338446 --
pancreatic islet 7 / 30771 -- -- -- 7 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 529 / 145854 -- 1 / 17986 -- 529 / 145854 --
placenta 7 / 37653 -- 966 / 292212 -- 7 / 37653 -- 966 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate 30 / 23701   707 / 386047 -- 30 / 23701 0 / 5 707 / 386047 --
retina 6 / 82470 -- 1110 / 636203 -- 6 / 82470 -- 1110 / 636203 --
salivary gland 1 / 18434   -- -- 1 / 18434 0 / 958 -- --
skin 9 / 85891   1837 / 615945 80 / 57574 9 / 85891 0 / 31511 1837 / 615945 80 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 7 / 73492 17 / 17831 1550 / 386635 -- 7 / 73492 17 / 17831 1550 / 386635 --
stem cell -- -- 752 / 234473 -- -- -- 752 / 234473 --
stomach 3 / 21241 -- 1267 / 218318 -- 3 / 21241 -- 1267 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 16 / 116987   2637 / 736319 -- 16 / 116987 0 / 2634 2637 / 736319 --
thymus 6 / 100203 8 / 20273 1166 / 346181 -- 6 / 100203 8 / 20273 1166 / 346181 --
thyroid 12 / 8821 -- -- -- 12 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 22 / 262740 3 / 14058 41 / 25954 -- 22 / 262740 3 / 14058 41 / 25954 --
uterus   -- 1221 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1221 / 206823 --
vascular   -- 1213 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 1213 / 1092595 --
white blood cells -- -- 626 / 398838 -- -- -- 626 / 398838 --
whole body -- -- 1491 / 531904 320 / 212613 -- -- 1491 / 531904 320 / 212613