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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.45785Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 78 / 3259021 5 / 403641 1943 / 25718729 27 / 491920 78 / 3259021 5 / 403641 1943 / 25718729 27 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 4 / 64924 -- 0 / 38915 -- 4 / 64924 --
bone marrow 4 / 100926 --   -- 4 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 4 / 261599   488 / 7554651 -- 4 / 261599 0 / 2128 488 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 18 / 233710 4 / 43127 1 / 56549 -- 18 / 233710 4 / 43127
cerebrum 1 / 228104 -- -- -- 1 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 6 / 39315 -- -- -- 6 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 25 / 718928   171 / 2760977 -- 25 / 718928 0 / 9837 171 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 7 / 211918 -- -- -- 7 / 211918 --
eye 9 / 94929 -- 16 / 138066 -- 9 / 94929 -- 16 / 138066 --
gastrointestinal tract 4 / 34979 -- 44 / 548222 -- 4 / 34979 -- 44 / 548222 --
heart   -- 68 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 68 / 1231698 --
kidney     222 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 222 / 1415985 --
limb   -- 24 / 595880 -- 0 / 16187 -- 24 / 595880 --
liver     41 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 41 / 527425 --
lung   1 / 72516 116 / 943009 -- 0 / 26861 1 / 72516 116 / 943009 --
lymph node   -- 26 / 344354 -- 0 / 14648 -- 26 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464 4 / 216846 109 / 960632 19 / 178606 3 / 85464 4 / 216846 109 / 960632 19 / 178606
muscle   -- 15 / 137075 -- 0 / 24130 -- 15 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 42 / 354066 -- 0 / 43149 -- 42 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   71 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 71 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 7 / 145854 -- 0 / 17986 -- 7 / 145854 --
placenta   -- 15 / 292212 -- 0 / 37653 -- 15 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate     31 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 31 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 35 / 636203 -- 2 / 82470 -- 35 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891   39 / 615945   1 / 85891 0 / 31511 39 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     53 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 53 / 386635 --
stem cell -- -- 5 / 234473 -- -- -- 5 / 234473 --
stomach   -- 30 / 218318 -- 0 / 21241 -- 30 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   125 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 125 / 736319 --
thymus 9 / 100203   27 / 346181 -- 9 / 100203 0 / 20273 27 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 3 / 262740     -- 3 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 22 / 206823 -- 0 / 6854 -- 22 / 206823 --
vascular   -- 50 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 50 / 1092595 --
white blood cells -- -- 5 / 398838 -- -- -- 5 / 398838 --
whole body -- -- 17 / 531904 4 / 212613 -- -- 17 / 531904 4 / 212613