Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.440021Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 257 / 3259021 5 / 403641 254 / 25718729 5 / 491920 257 / 3259021 5 / 403641 254 / 25718729 5 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 2 / 64924 -- 0 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 40 / 261599   83 / 7554651 -- 40 / 261599 0 / 2128 83 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 35 / 56549 -- 3 / 233710   35 / 56549 -- 3 / 233710 0 / 43127
cerebrum 13 / 228104 -- -- -- 13 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 72 / 718928   23 / 2760977 -- 72 / 718928 0 / 9837 23 / 2760977 --
endocrine 2 / 2473 -- -- -- 2 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 4 / 211918 -- -- -- 4 / 211918 --
eye 30 / 94929 -- 1 / 138066 -- 30 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 3 / 548222 -- 0 / 34979 -- 3 / 548222 --
heart 1 / 49793 -- 17 / 1231698 -- 1 / 49793 -- 17 / 1231698 --
kidney 3 / 121184   7 / 1415985 -- 3 / 121184 0 / 2215 7 / 1415985 --
limb   -- 13 / 595880 -- 0 / 16187 -- 13 / 595880 --
liver 5 / 104633   3 / 527425 -- 5 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung 5 / 26861 2 / 72516 11 / 943009 -- 5 / 26861 2 / 72516 11 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 --   -- 2 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland   3 / 216846 6 / 960632   0 / 85464 3 / 216846 6 / 960632 0 / 178606
muscle 2 / 24130 --   -- 2 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary 3 / 43149 -- 2 / 354066 -- 3 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas     27 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 27 / 1338446 --
pancreatic islet 1 / 30771 -- -- -- 1 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland 2 / 17986 -- 1 / 145854 -- 2 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 1 / 292212 -- 2 / 37653 -- 1 / 292212 --
pooled tissue 4 / 99675 -- -- -- 4 / 99675 -- -- --
prostate     3 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 3 / 386047 --
retina 10 / 82470 -- 5 / 636203 -- 10 / 82470 -- 5 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 4 / 85891   1 / 615945   4 / 85891 0 / 31511 1 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach   -- 3 / 218318 -- 0 / 21241 -- 3 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 3 / 116987   1 / 736319 -- 3 / 116987 0 / 2634 1 / 736319 --
thymus 1 / 100203     -- 1 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 8 / 262740   1 / 25954 -- 8 / 262740 0 / 14058 1 / 25954 --
uterus 1 / 6854 --   -- 1 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 30 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 30 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904 5 / 212613 -- -- 2 / 531904 5 / 212613