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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.439963Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 100 / 3259021 1 / 403641 70 / 25718729 6 / 491920 100 / 3259021 1 / 403641 70 / 25718729 6 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 1 / 261599   5 / 7554651 -- 1 / 261599 0 / 2128 5 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 1 / 233710   0 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 22 / 718928   3 / 2760977 -- 22 / 718928 0 / 9837 3 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 2 / 94929 --   -- 2 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 2 / 548222 -- 0 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart 1 / 49793 --   -- 1 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney 3 / 121184   1 / 1415985 -- 3 / 121184 0 / 2215 1 / 1415985 --
limb   -- 5 / 595880 -- 0 / 16187 -- 5 / 595880 --
liver 12 / 104633     -- 12 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung     4 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 4 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 4 / 85464 1 / 216846 2 / 960632 2 / 178606 4 / 85464 1 / 216846 2 / 960632 2 / 178606
muscle 5 / 24130 -- 3 / 137075 -- 5 / 24130 -- 3 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 17 / 43149 -- 1 / 354066 -- 17 / 43149 -- 1 / 354066 --
pancreas 8 / 75220   11 / 1338446 -- 8 / 75220 0 / 34 11 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701   1 / 386047 -- 2 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina   -- 1 / 636203 -- 0 / 82470 -- 1 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     5 / 615945 2 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 5 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach 1 / 21241 --   -- 1 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     10 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 10 / 736319 --
thymus 2 / 100203   1 / 346181 -- 2 / 100203 0 / 20273 1 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 17 / 262740     -- 17 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 2 / 206823 -- 0 / 6854 -- 2 / 206823 --
vascular   -- 1 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 1 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 11 / 531904 2 / 212613 -- -- 11 / 531904 2 / 212613