Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.436572Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 184 / 3259021 19 / 403641 655 / 25718729 10 / 491920 184 / 3259021 19 / 403641 655 / 25718729 10 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 1 / 38915 -- 2 / 64924 -- 1 / 38915 -- 2 / 64924 --
bone marrow 4 / 100926 --   -- 4 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 15 / 261599   65 / 7554651 -- 15 / 261599 0 / 2128 65 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 5 / 56549 -- 8 / 233710   5 / 56549 -- 8 / 233710 0 / 43127
cerebrum 7 / 228104 -- -- -- 7 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 3 / 51804   -- -- 3 / 51804 0 / 689 -- --
ear 1 / 39315 -- -- -- 1 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 62 / 718928   91 / 2760977 -- 62 / 718928 0 / 9837 91 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 9 / 211918 -- -- -- 9 / 211918 --
eye 11 / 94929 -- 3 / 138066 -- 11 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract 2 / 34979 -- 39 / 548222 -- 2 / 34979 -- 39 / 548222 --
heart 2 / 49793 -- 34 / 1231698 -- 2 / 49793 -- 34 / 1231698 --
kidney 9 / 121184   59 / 1415985 -- 9 / 121184 0 / 2215 59 / 1415985 --
limb   -- 24 / 595880 -- 0 / 16187 -- 24 / 595880 --
liver 11 / 104633   3 / 527425 -- 11 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung 2 / 26861 2 / 72516 47 / 943009 -- 2 / 26861 2 / 72516 47 / 943009 --
lymph node   -- 10 / 344354 -- 0 / 14648 -- 10 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 6 / 85464 13 / 216846 23 / 960632 5 / 178606 6 / 85464 13 / 216846 23 / 960632 5 / 178606
muscle   -- 8 / 137075 -- 0 / 24130 -- 8 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary   -- 16 / 354066 -- 0 / 43149 -- 16 / 354066 --
pancreas 4 / 75220   24 / 1338446 -- 4 / 75220 0 / 34 24 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 --   -- 1 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 4 / 37653 -- 5 / 292212 -- 4 / 37653 -- 5 / 292212 --
pooled tissue 2 / 99675 -- -- -- 2 / 99675 -- -- --
prostate     13 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 13 / 386047 --
retina 2 / 82470 -- 11 / 636203 -- 2 / 82470 -- 11 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 3 / 85891 4 / 31511 18 / 615945 3 / 57574 3 / 85891 4 / 31511 18 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     19 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 19 / 386635 --
stem cell -- -- 3 / 234473 -- -- -- 3 / 234473 --
stomach   -- 12 / 218318 -- 0 / 21241 -- 12 / 218318 --
synovium 1 / 16875 -- -- -- 1 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987   22 / 736319 -- 1 / 116987 0 / 2634 22 / 736319 --
thymus 4 / 100203   11 / 346181 -- 4 / 100203 0 / 20273 11 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 19 / 262740     -- 19 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 16 / 206823 -- 0 / 6854 -- 16 / 206823 --
vascular   -- 53 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 53 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 7 / 531904 2 / 212613 -- -- 7 / 531904 2 / 212613