Skip Navigation
NCI banner National Cancer Institute U.S. National Institutes of Health National Cancer Institute
Tissues
  • Tools
  • SNPs by tissue
  • CGAP Data
Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.43636Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 274 / 3259021 50 / 403641 845 / 25718729 22 / 491920 274 / 3259021 50 / 403641 845 / 25718729 22 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 -- 3 / 64924 -- 3 / 38915 -- 3 / 64924 --
bone marrow 5 / 100926 -- 2 / 103390 -- 5 / 100926 -- 2 / 103390 --
brain 12 / 261599   204 / 7554651 -- 12 / 261599 0 / 2128 204 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 1 / 56549 -- 4 / 233710 1 / 43127 1 / 56549 -- 4 / 233710 1 / 43127
cerebrum 82 / 228104 -- -- -- 82 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 3 / 39315 -- -- -- 3 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 47 / 718928   79 / 2760977 -- 47 / 718928 0 / 9837 79 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 5 / 211918 -- -- -- 5 / 211918 --
eye 9 / 94929 -- 3 / 138066 -- 9 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 31 / 548222 -- 0 / 34979 -- 31 / 548222 --
heart 7 / 49793 -- 58 / 1231698 -- 7 / 49793 -- 58 / 1231698 --
kidney 14 / 121184   45 / 1415985 -- 14 / 121184 0 / 2215 45 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 26 / 595880 -- 1 / 16187 -- 26 / 595880 --
liver 12 / 104633 1 / 6685 19 / 527425 -- 12 / 104633 1 / 6685 19 / 527425 --
lung   9 / 72516 34 / 943009 -- 0 / 26861 9 / 72516 34 / 943009 --
lymph node   -- 12 / 344354 -- 0 / 14648 -- 12 / 344354 --
lymphoreticular   2 / 5421 -- -- 0 / 3137 2 / 5421 -- --
mammary gland 1 / 85464 10 / 216846 27 / 960632 9 / 178606 1 / 85464 10 / 216846 27 / 960632 9 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 14 / 137075 -- 1 / 24130 -- 14 / 137075 --
nervous 5 / 35780 -- -- -- 5 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 12 / 354066 -- 1 / 43149 -- 12 / 354066 --
pancreas 12 / 75220   37 / 1338446 -- 12 / 75220 0 / 34 37 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 2 / 145854 -- 0 / 17986 -- 2 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 6 / 292212 -- 1 / 37653 -- 6 / 292212 --
pooled tissue 7 / 99675 -- -- -- 7 / 99675 -- -- --
prostate     16 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 16 / 386047 --
retina 11 / 82470 -- 38 / 636203 -- 11 / 82470 -- 38 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891 2 / 31511 34 / 615945 7 / 57574 1 / 85891 2 / 31511 34 / 615945 7 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 4 / 73492 24 / 17831 9 / 386635 -- 4 / 73492 24 / 17831 9 / 386635 --
stem cell -- -- 6 / 234473 -- -- -- 6 / 234473 --
stomach   -- 14 / 218318 -- 0 / 21241 -- 14 / 218318 --
synovium 2 / 16875 -- -- -- 2 / 16875 -- -- --
testis 6 / 116987   16 / 736319 -- 6 / 116987 0 / 2634 16 / 736319 --
thymus     28 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 28 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 23 / 262740 2 / 14058   -- 23 / 262740 2 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 9 / 206823 -- 0 / 6854 -- 9 / 206823 --
vascular   -- 25 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 25 / 1092595 --
white blood cells -- -- 13 / 398838 -- -- -- 13 / 398838 --
whole body -- -- 14 / 531904 5 / 212613 -- -- 14 / 531904 5 / 212613