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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.428652Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 645 / 3259021 111 / 403641 2377 / 25718729 12 / 491920 645 / 3259021 111 / 403641 2377 / 25718729 12 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 8 / 38915 -- 9 / 64924 -- 8 / 38915 -- 9 / 64924 --
bone marrow 34 / 100926 -- 5 / 103390 -- 34 / 100926 -- 5 / 103390 --
brain 8 / 261599   286 / 7554651 -- 8 / 261599 0 / 2128 286 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 3 / 56549 -- 16 / 233710   3 / 56549 -- 16 / 233710 0 / 43127
cerebrum 34 / 228104 -- -- -- 34 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 7 / 51804 1 / 689 -- -- 7 / 51804 1 / 689 -- --
ear 15 / 39315 -- -- -- 15 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 107 / 718928 2 / 9837 385 / 2760977 -- 107 / 718928 2 / 9837 385 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 11 / 211918 -- -- -- 11 / 211918 --
eye 7 / 94929 -- 23 / 138066 -- 7 / 94929 -- 23 / 138066 --
gastrointestinal tract 22 / 34979 -- 52 / 548222 -- 22 / 34979 -- 52 / 548222 --
heart 16 / 49793 -- 263 / 1231698 -- 16 / 49793 -- 263 / 1231698 --
kidney 9 / 121184 1 / 2215 139 / 1415985 -- 9 / 121184 1 / 2215 139 / 1415985 --
limb   -- 64 / 595880 -- 0 / 16187 -- 64 / 595880 --
liver 6 / 104633   37 / 527425 -- 6 / 104633 0 / 6685 37 / 527425 --
lung 6 / 26861 18 / 72516 160 / 943009 -- 6 / 26861 18 / 72516 160 / 943009 --
lymph node 1 / 14648 -- 30 / 344354 -- 1 / 14648 -- 30 / 344354 --
lymphoreticular   3 / 5421 -- -- 0 / 3137 3 / 5421 -- --
mammary gland 10 / 85464 52 / 216846 73 / 960632 3 / 178606 10 / 85464 52 / 216846 73 / 960632 3 / 178606
muscle 2 / 24130 -- 19 / 137075 -- 2 / 24130 -- 19 / 137075 --
nervous 14 / 35780 -- -- -- 14 / 35780 -- -- --
ovary 4 / 43149 -- 52 / 354066 -- 4 / 43149 -- 52 / 354066 --
pancreas 47 / 75220   137 / 1338446 -- 47 / 75220 0 / 34 137 / 1338446 --
pancreatic islet 3 / 30771 -- -- -- 3 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 11 / 9981 -- -- -- 11 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland 11 / 17986 -- 7 / 145854 -- 11 / 17986 -- 7 / 145854 --
placenta 37 / 37653 -- 42 / 292212 -- 37 / 37653 -- 42 / 292212 --
pooled tissue 20 / 99675 -- -- -- 20 / 99675 -- -- --
prostate 5 / 23701   60 / 386047 -- 5 / 23701 0 / 5 60 / 386047 --
retina 7 / 82470 -- 13 / 636203 -- 7 / 82470 -- 13 / 636203 --
salivary gland   1 / 958 -- -- 0 / 18434 1 / 958 -- --
skin 20 / 85891 15 / 31511 67 / 615945 3 / 57574 20 / 85891 15 / 31511 67 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 19 / 73492 7 / 17831 54 / 386635 -- 19 / 73492 7 / 17831 54 / 386635 --
stem cell -- -- 16 / 234473 -- -- -- 16 / 234473 --
stomach 6 / 21241 -- 38 / 218318 -- 6 / 21241 -- 38 / 218318 --
synovium 23 / 16875 -- -- -- 23 / 16875 -- -- --
testis 18 / 116987   107 / 736319 -- 18 / 116987 0 / 2634 107 / 736319 --
thymus 16 / 100203 6 / 20273 39 / 346181 -- 16 / 100203 6 / 20273 39 / 346181 --
thyroid 4 / 8821 -- -- -- 4 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 78 / 262740 5 / 14058 1 / 25954 -- 78 / 262740 5 / 14058 1 / 25954 --
uterus 2 / 6854 -- 40 / 206823 -- 2 / 6854 -- 40 / 206823 --
vascular 2 / 12366 -- 101 / 1092595 -- 2 / 12366 -- 101 / 1092595 --
white blood cells -- -- 13 / 398838 -- -- -- 13 / 398838 --
whole body -- -- 18 / 531904 6 / 212613 -- -- 18 / 531904 6 / 212613