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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.423023Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 90 / 3259021   3982 / 25718729 4 / 491920 90 / 3259021 0 / 403641 3982 / 25718729 4 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 81 / 64924 -- 0 / 38915 -- 81 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain     37 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 37 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 1 / 233710   0 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 51 / 718928   21 / 2760977 -- 51 / 718928 0 / 9837 21 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 3 / 211918 -- -- -- 3 / 211918 --
eye   -- 3 / 138066 -- 0 / 94929 -- 3 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 2 / 548222 -- 0 / 34979 -- 2 / 548222 --
heart   -- 87 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 87 / 1231698 --
kidney     46 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 46 / 1415985 --
limb 1 / 16187 -- 15 / 595880 -- 1 / 16187 -- 15 / 595880 --
liver 16 / 104633   2518 / 527425 -- 16 / 104633 0 / 6685 2518 / 527425 --
lung     48 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 48 / 943009 --
lymph node 6 / 14648 -- 1 / 344354 -- 6 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     1 / 960632 4 / 178606 0 / 85464 0 / 216846 1 / 960632 4 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary   -- 34 / 354066 -- 0 / 43149 -- 34 / 354066 --
pancreas     67 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 67 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta 1 / 37653 -- 16 / 292212 -- 1 / 37653 -- 16 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate     1 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 1 / 386047 --
retina   -- 4 / 636203 -- 0 / 82470 -- 4 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     17 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 17 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 8 / 73492   630 / 386635 -- 8 / 73492 0 / 17831 630 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach   -- 11 / 218318 -- 0 / 21241 -- 11 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     84 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 84 / 736319 --
thymus     18 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 18 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 4 / 262740     -- 4 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 4 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 4 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 229 / 531904   -- -- 229 / 531904 0 / 212613