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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.42242Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 138 / 3259021   250 / 25718729   138 / 3259021 0 / 403641 250 / 25718729 0 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 2 / 38915 --   -- 2 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 14 / 261599   46 / 7554651 -- 14 / 261599 0 / 2128 46 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 7 / 39315 -- -- -- 7 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 20 / 718928   87 / 2760977 -- 20 / 718928 0 / 9837 87 / 2760977 --
endocrine 2 / 2473 -- -- -- 2 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 3 / 94929 --   -- 3 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 1 / 548222 -- 0 / 34979 -- 1 / 548222 --
heart   -- 9 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 9 / 1231698 --
kidney     1 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 1 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver     2 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 2 / 527425 --
lung     2 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 2 / 943009 --
lymph node   -- 2 / 344354 -- 0 / 14648 -- 2 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland         0 / 85464 0 / 216846 0 / 960632 0 / 178606
muscle   --   -- 0 / 24130 -- 0 / 137075 --
nervous 17 / 35780 -- -- -- 17 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 2 / 354066 -- 1 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas 33 / 75220   54 / 1338446 -- 33 / 75220 0 / 34 54 / 1338446 --
pancreatic islet 6 / 30771 -- -- -- 6 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 2 / 9981 -- -- -- 2 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 1 / 145854 -- 1 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate     4 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 4 / 386047 --
retina 19 / 82470 -- 22 / 636203 -- 19 / 82470 -- 22 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 1 / 85891       1 / 85891 0 / 31511 0 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen       -- 0 / 73492 0 / 17831 0 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 12 / 218318 -- 0 / 21241 -- 12 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987     -- 1 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus 4 / 100203   2 / 346181 -- 4 / 100203 0 / 20273 2 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 2 / 262740     -- 2 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   --   -- 0 / 12366 -- 0 / 1092595 --
white blood cells -- -- 1 / 398838 -- -- -- 1 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904   -- -- 2 / 531904 0 / 212613