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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.42233Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 4 / 3259021   611 / 25718729 11 / 491920 4 / 3259021 0 / 403641 611 / 25718729 11 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 1 / 64924 -- 0 / 38915 -- 1 / 64924 --
bone marrow   -- 4 / 103390 -- 0 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain     170 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 170 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   -- 5 / 233710   0 / 56549 -- 5 / 233710 0 / 43127
cerebrum   -- -- -- 0 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue     77 / 2760977 -- 0 / 718928 0 / 9837 77 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 4 / 211918 -- -- -- 4 / 211918 --
eye   -- 1 / 138066 -- 0 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 11 / 548222 -- 0 / 34979 -- 11 / 548222 --
heart   -- 21 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 21 / 1231698 --
kidney     34 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 34 / 1415985 --
limb   -- 20 / 595880 -- 0 / 16187 -- 20 / 595880 --
liver     5 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 5 / 527425 --
lung     21 / 943009 -- 0 / 26861 0 / 72516 21 / 943009 --
lymph node   -- 10 / 344354 -- 0 / 14648 -- 10 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     25 / 960632 4 / 178606 0 / 85464 0 / 216846 25 / 960632 4 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous   -- -- -- 0 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 7 / 354066 -- 1 / 43149 -- 7 / 354066 --
pancreas     34 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 34 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   -- 7 / 292212 -- 0 / 37653 -- 7 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate     14 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 14 / 386047 --
retina   -- 36 / 636203 -- 0 / 82470 -- 36 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     21 / 615945 2 / 57574 0 / 85891 0 / 31511 21 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     9 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 9 / 386635 --
stem cell -- -- 6 / 234473 -- -- -- 6 / 234473 --
stomach   -- 8 / 218318 -- 0 / 21241 -- 8 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     16 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 16 / 736319 --
thymus     8 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 8 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue       -- 0 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 6 / 206823 -- 0 / 6854 -- 6 / 206823 --
vascular   -- 15 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 15 / 1092595 --
white blood cells -- -- 10 / 398838 -- -- -- 10 / 398838 --
whole body -- -- 3 / 531904 5 / 212613 -- -- 3 / 531904 5 / 212613