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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.4222Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 1371 / 3259021 310 / 403641 19153 / 25718729 436 / 491920 1371 / 3259021 310 / 403641 19153 / 25718729 436 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 13 / 38915 -- 12 / 64924 -- 13 / 38915 -- 12 / 64924 --
bone marrow 53 / 100926 -- 41 / 103390 -- 53 / 100926 -- 41 / 103390 --
brain 65 / 261599   5641 / 7554651 -- 65 / 261599 0 / 2128 5641 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 3 / 56549 -- 109 / 233710 44 / 43127 3 / 56549 -- 109 / 233710 44 / 43127
cerebrum 145 / 228104 -- -- -- 145 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 38 / 51804 1 / 689 -- -- 38 / 51804 1 / 689 -- --
ear 5 / 39315 -- -- -- 5 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 334 / 718928 8 / 9837 2605 / 2760977 -- 334 / 718928 8 / 9837 2605 / 2760977 --
endocrine 1 / 2473 -- -- -- 1 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 132 / 211918 -- -- -- 132 / 211918 --
eye 52 / 94929 -- 159 / 138066 -- 52 / 94929 -- 159 / 138066 --
gastrointestinal tract 6 / 34979 -- 558 / 548222 -- 6 / 34979 -- 558 / 548222 --
heart 75 / 49793 -- 2068 / 1231698 -- 75 / 49793 -- 2068 / 1231698 --
kidney 136 / 121184 3 / 2215 1623 / 1415985 -- 136 / 121184 3 / 2215 1623 / 1415985 --
limb 20 / 16187 -- 423 / 595880 -- 20 / 16187 -- 423 / 595880 --
liver 63 / 104633 2 / 6685 237 / 527425 -- 63 / 104633 2 / 6685 237 / 527425 --
lung 5 / 26861 67 / 72516 669 / 943009 -- 5 / 26861 67 / 72516 669 / 943009 --
lymph node   -- 26 / 344354 -- 0 / 14648 -- 26 / 344354 --
lymphoreticular 9 / 3137 11 / 5421 -- -- 9 / 3137 11 / 5421 -- --
mammary gland 16 / 85464 124 / 216846 506 / 960632 231 / 178606 16 / 85464 124 / 216846 506 / 960632 231 / 178606
muscle 45 / 24130 -- 438 / 137075 -- 45 / 24130 -- 438 / 137075 --
nervous 5 / 35780 -- -- -- 5 / 35780 -- -- --
ovary 5 / 43149 -- 162 / 354066 -- 5 / 43149 -- 162 / 354066 --
pancreas 16 / 75220   464 / 1338446 -- 16 / 75220 0 / 34 464 / 1338446 --
pancreatic islet 4 / 30771 -- -- -- 4 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland 4 / 17986 -- 34 / 145854 -- 4 / 17986 -- 34 / 145854 --
placenta 8 / 37653 -- 372 / 292212 -- 8 / 37653 -- 372 / 292212 --
pooled tissue 32 / 99675 -- -- -- 32 / 99675 -- -- --
prostate 10 / 23701   139 / 386047 -- 10 / 23701 0 / 5 139 / 386047 --
retina 40 / 82470 -- 540 / 636203 -- 40 / 82470 -- 540 / 636203 --
salivary gland 8 / 18434   -- -- 8 / 18434 0 / 958 -- --
skin 17 / 85891 3 / 31511 443 / 615945 35 / 57574 17 / 85891 3 / 31511 443 / 615945 35 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 5 / 73492 51 / 17831 346 / 386635 -- 5 / 73492 51 / 17831 346 / 386635 --
stem cell -- -- 68 / 234473 -- -- -- 68 / 234473 --
stomach 6 / 21241 -- 224 / 218318 -- 6 / 21241 -- 224 / 218318 --
synovium 19 / 16875 -- -- -- 19 / 16875 -- -- --
testis 25 / 116987 3 / 2634 392 / 736319 -- 25 / 116987 3 / 2634 392 / 736319 --
thymus 4 / 100203 21 / 20273 153 / 346181 -- 4 / 100203 21 / 20273 153 / 346181 --
thyroid 4 / 8821 -- -- -- 4 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 73 / 262740 16 / 14058   -- 73 / 262740 16 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 121 / 206823 -- 0 / 6854 -- 121 / 206823 --
vascular   -- 98 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 98 / 1092595 --
white blood cells -- -- 29 / 398838 -- -- -- 29 / 398838 --
whole body -- -- 321 / 531904 126 / 212613 -- -- 321 / 531904 126 / 212613