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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.42162Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 77 / 3259021   268 / 25718729 13 / 491920 77 / 3259021 0 / 403641 268 / 25718729 13 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 2 / 261599   11 / 7554651 -- 2 / 261599 0 / 2128 11 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 3 / 56549 -- 1 / 233710   3 / 56549 -- 1 / 233710 0 / 43127
cerebrum 1 / 228104 -- -- -- 1 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 23 / 718928   16 / 2760977 -- 23 / 718928 0 / 9837 16 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 2 / 211918 -- -- -- 2 / 211918 --
eye 1 / 94929 -- 4 / 138066 -- 1 / 94929 -- 4 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 10 / 548222 -- 0 / 34979 -- 10 / 548222 --
heart 8 / 49793 -- 19 / 1231698 -- 8 / 49793 -- 19 / 1231698 --
kidney 3 / 121184   9 / 1415985 -- 3 / 121184 0 / 2215 9 / 1415985 --
limb   -- 6 / 595880 -- 0 / 16187 -- 6 / 595880 --
liver     1 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 1 / 527425 --
lung 5 / 26861   27 / 943009 -- 5 / 26861 0 / 72516 27 / 943009 --
lymph node   -- 1 / 344354 -- 0 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland     10 / 960632 11 / 178606 0 / 85464 0 / 216846 10 / 960632 11 / 178606
muscle   -- 5 / 137075 -- 0 / 24130 -- 5 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary   -- 6 / 354066 -- 0 / 43149 -- 6 / 354066 --
pancreas     8 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 8 / 1338446 --
pancreatic islet 3 / 30771 -- -- -- 3 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system 1 / 9981 -- -- -- 1 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   --   -- 0 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta   -- 7 / 292212 -- 0 / 37653 -- 7 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 8 / 85891   19 / 615945 2 / 57574 8 / 85891 0 / 31511 19 / 615945 2 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 5 / 73492   8 / 386635 -- 5 / 73492 0 / 17831 8 / 386635 --
stem cell -- --   -- -- -- 0 / 234473 --
stomach   -- 2 / 218318 -- 0 / 21241 -- 2 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis 1 / 116987     -- 1 / 116987 0 / 2634 0 / 736319 --
thymus     2 / 346181 -- 0 / 100203 0 / 20273 2 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 4 / 262740     -- 4 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 4 / 206823 -- 0 / 6854 -- 4 / 206823 --
vascular 6 / 12366 -- 88 / 1092595 -- 6 / 12366 -- 88 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- -- 2 / 531904   -- -- 2 / 531904 0 / 212613