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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.41708Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 157 / 3259021   329 / 25718729 4 / 491920 157 / 3259021 0 / 403641 329 / 25718729 4 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   --   -- 0 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow   --   -- 0 / 100926 -- 0 / 103390 --
brain 49 / 261599   167 / 7554651 -- 49 / 261599 0 / 2128 167 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 32 / 56549 -- 1 / 233710 4 / 43127 32 / 56549 -- 1 / 233710 4 / 43127
cerebrum 43 / 228104 -- -- -- 43 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear   -- -- -- 0 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 3 / 718928   33 / 2760977 -- 3 / 718928 0 / 9837 33 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 4 / 211918 -- -- -- 4 / 211918 --
eye 1 / 94929 -- 1 / 138066 -- 1 / 94929 -- 1 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 6 / 548222 -- 0 / 34979 -- 6 / 548222 --
heart   -- 5 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 5 / 1231698 --
kidney     16 / 1415985 -- 0 / 121184 0 / 2215 16 / 1415985 --
limb   -- 1 / 595880 -- 0 / 16187 -- 1 / 595880 --
liver     3 / 527425 -- 0 / 104633 0 / 6685 3 / 527425 --
lung 7 / 26861   43 / 943009 -- 7 / 26861 0 / 72516 43 / 943009 --
lymph node   --   -- 0 / 14648 -- 0 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 3 / 85464       3 / 85464 0 / 216846 0 / 960632 0 / 178606
muscle   -- 1 / 137075 -- 0 / 24130 -- 1 / 137075 --
nervous 3 / 35780 -- -- -- 3 / 35780 -- -- --
ovary   -- 7 / 354066 -- 0 / 43149 -- 7 / 354066 --
pancreas     14 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 14 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland   -- 1 / 145854 -- 0 / 17986 -- 1 / 145854 --
placenta   --   -- 0 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue 8 / 99675 -- -- -- 8 / 99675 -- -- --
prostate     5 / 386047 -- 0 / 23701 0 / 5 5 / 386047 --
retina 3 / 82470 -- 1 / 636203 -- 3 / 82470 -- 1 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin     2 / 615945   0 / 85891 0 / 31511 2 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen     1 / 386635 -- 0 / 73492 0 / 17831 1 / 386635 --
stem cell -- -- 2 / 234473 -- -- -- 2 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     2 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus       -- 0 / 100203 0 / 20273 0 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 5 / 262740     -- 5 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 1 / 206823 -- 0 / 6854 -- 1 / 206823 --
vascular   -- 12 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 12 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- --     -- -- 0 / 531904 0 / 212613