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Cancer Genome Characterization Initiative

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Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.41558Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 138 / 3259021 49 / 403641 1636 / 25718729 23 / 491920 138 / 3259021 49 / 403641 1636 / 25718729 23 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone   -- 5 / 64924 -- 0 / 38915 -- 5 / 64924 --
bone marrow 5 / 100926 -- 4 / 103390 -- 5 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain 11 / 261599   542 / 7554651 -- 11 / 261599 0 / 2128 542 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum 2 / 56549 -- 8 / 233710   2 / 56549 -- 8 / 233710 0 / 43127
cerebrum 8 / 228104 -- -- -- 8 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon     -- -- 0 / 51804 0 / 689 -- --
ear 3 / 39315 -- -- -- 3 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 33 / 718928 3 / 9837 205 / 2760977 -- 33 / 718928 3 / 9837 205 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- -- 8 / 211918 -- -- -- 8 / 211918 --
eye 2 / 94929 -- 18 / 138066 -- 2 / 94929 -- 18 / 138066 --
gastrointestinal tract   -- 38 / 548222 -- 0 / 34979 -- 38 / 548222 --
heart   -- 74 / 1231698 -- 0 / 49793 -- 74 / 1231698 --
kidney 16 / 121184   103 / 1415985 -- 16 / 121184 0 / 2215 103 / 1415985 --
limb   -- 26 / 595880 -- 0 / 16187 -- 26 / 595880 --
liver 3 / 104633   10 / 527425 -- 3 / 104633 0 / 6685 10 / 527425 --
lung   11 / 72516 103 / 943009 -- 0 / 26861 11 / 72516 103 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 9 / 344354 -- 2 / 14648 -- 9 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 8 / 85464 17 / 216846 34 / 960632 11 / 178606 8 / 85464 17 / 216846 34 / 960632 11 / 178606
muscle   -- 8 / 137075 -- 0 / 24130 -- 8 / 137075 --
nervous 1 / 35780 -- -- -- 1 / 35780 -- -- --
ovary 1 / 43149 -- 14 / 354066 -- 1 / 43149 -- 14 / 354066 --
pancreas 3 / 75220   58 / 1338446 -- 3 / 75220 0 / 34 58 / 1338446 --
pancreatic islet 3 / 30771 -- -- -- 3 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland 1 / 3907 -- -- -- 1 / 3907 -- -- --
pituitary gland 1 / 17986 -- 5 / 145854 -- 1 / 17986 -- 5 / 145854 --
placenta 2 / 37653 -- 28 / 292212 -- 2 / 37653 -- 28 / 292212 --
pooled tissue 3 / 99675 -- -- -- 3 / 99675 -- -- --
prostate 2 / 23701   21 / 386047 -- 2 / 23701 0 / 5 21 / 386047 --
retina 1 / 82470 -- 24 / 636203 -- 1 / 82470 -- 24 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 2 / 85891 18 / 31511 20 / 615945 3 / 57574 2 / 85891 18 / 31511 20 / 615945 3 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 7 / 73492   29 / 386635 -- 7 / 73492 0 / 17831 29 / 386635 --
stem cell -- -- 4 / 234473 -- -- -- 4 / 234473 --
stomach 1 / 21241 -- 9 / 218318 -- 1 / 21241 -- 9 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     29 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 29 / 736319 --
thymus 4 / 100203   9 / 346181 -- 4 / 100203 0 / 20273 9 / 346181 --
thyroid 1 / 8821 -- -- -- 1 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 12 / 262740     -- 12 / 262740 0 / 14058 0 / 25954 --
uterus   -- 13 / 206823 -- 0 / 6854 -- 13 / 206823 --
vascular   -- 162 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 162 / 1092595 --
white blood cells -- -- 5 / 398838 -- -- -- 5 / 398838 --
whole body -- -- 11 / 531904 9 / 212613 -- -- 11 / 531904 9 / 212613