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Cancer Genome Characterization Initiative

Visit the database of genomic characterization data for multiple tumor types.


Virtual Northern

Expression Pattern for cluster Mm.4081Text Legend

TissueEST DataSAGE DataEST DataSAGE Data
NormalCancerNormalCancerNormalCancerNormalCancer
ALL TISSUES 100 / 3259021 22 / 403641 59 / 25718729 4 / 491920 100 / 3259021 22 / 403641 59 / 25718729 4 / 491920
adrenal cortex -- -- -- -- -- -- -- --
adrenal medulla -- -- -- -- -- -- -- --
bone 3 / 38915 --   -- 3 / 38915 -- 0 / 64924 --
bone marrow 7 / 100926 -- 4 / 103390 -- 7 / 100926 -- 4 / 103390 --
brain     3 / 7554651 -- 0 / 261599 0 / 2128 3 / 7554651 --
cartilage   -- -- -- 0 / 266 -- -- --
cerebellum   --     0 / 56549 -- 0 / 233710 0 / 43127
cerebrum 1 / 228104 -- -- -- 1 / 228104 -- -- --
cervix -- -- -- -- -- -- -- --
colon 1 / 51804   -- -- 1 / 51804 0 / 689 -- --
ear 2 / 39315 -- -- -- 2 / 39315 -- -- --
embryonic tissue 1 / 718928 3 / 9837 7 / 2760977 -- 1 / 718928 3 / 9837 7 / 2760977 --
endocrine   -- -- -- 0 / 2473 -- -- --
esophagus -- --   -- -- -- 0 / 211918 --
eye 1 / 94929 --   -- 1 / 94929 -- 0 / 138066 --
gastrointestinal tract   --   -- 0 / 34979 -- 0 / 548222 --
heart   --   -- 0 / 49793 -- 0 / 1231698 --
kidney       -- 0 / 121184 0 / 2215 0 / 1415985 --
limb   --   -- 0 / 16187 -- 0 / 595880 --
liver 3 / 104633     -- 3 / 104633 0 / 6685 0 / 527425 --
lung 2 / 26861 3 / 72516 7 / 943009 -- 2 / 26861 3 / 72516 7 / 943009 --
lymph node 2 / 14648 -- 1 / 344354 -- 2 / 14648 -- 1 / 344354 --
lymphoreticular     -- -- 0 / 3137 0 / 5421 -- --
mammary gland 7 / 85464 14 / 216846 10 / 960632 3 / 178606 7 / 85464 14 / 216846 10 / 960632 3 / 178606
muscle 1 / 24130 -- 2 / 137075 -- 1 / 24130 -- 2 / 137075 --
nervous 2 / 35780 -- -- -- 2 / 35780 -- -- --
ovary   -- 2 / 354066 -- 0 / 43149 -- 2 / 354066 --
pancreas     1 / 1338446 -- 0 / 75220 0 / 34 1 / 1338446 --
pancreatic islet   -- -- -- 0 / 30771 -- -- --
parathyroid -- -- -- -- -- -- -- --
peripheral nervous system   -- -- -- 0 / 9981 -- -- --
pineal gland   -- -- -- 0 / 3907 -- -- --
pituitary gland 3 / 17986 --   -- 3 / 17986 -- 0 / 145854 --
placenta 5 / 37653 --   -- 5 / 37653 -- 0 / 292212 --
pooled tissue   -- -- -- 0 / 99675 -- -- --
prostate       -- 0 / 23701 0 / 5 0 / 386047 --
retina   --   -- 0 / 82470 -- 0 / 636203 --
salivary gland     -- -- 0 / 18434 0 / 958 -- --
skin 11 / 85891   8 / 615945   11 / 85891 0 / 31511 8 / 615945 0 / 57574
soft tissue -- -- -- -- -- -- -- --
spleen 12 / 73492   3 / 386635 -- 12 / 73492 0 / 17831 3 / 386635 --
stem cell -- -- 1 / 234473 -- -- -- 1 / 234473 --
stomach   --   -- 0 / 21241 -- 0 / 218318 --
synovium   -- -- -- 0 / 16875 -- -- --
testis     2 / 736319 -- 0 / 116987 0 / 2634 2 / 736319 --
thymus 20 / 100203   7 / 346181 -- 20 / 100203 0 / 20273 7 / 346181 --
thyroid   -- -- -- 0 / 8821 -- -- --
uncharacterized tissue 16 / 262740 2 / 14058   -- 16 / 262740 2 / 14058 0 / 25954 --
uterus   --   -- 0 / 6854 -- 0 / 206823 --
vascular   -- 1 / 1092595 -- 0 / 12366 -- 1 / 1092595 --
white blood cells -- --   -- -- -- 0 / 398838 --
whole body -- --   1 / 212613 -- -- 0 / 531904 1 / 212613